Prosím počkejte chvíli...
stdClass Object
(
    [nazev] => Ústav biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha
    [adresa_url] => 
    [api_hash] => 
    [seo_desc] => 
    [jazyk] => cs
    [jednojazycny] => 
    [barva] => 
    [indexace] => 1
    [obrazek] => 
    [ga_force] => 
    [cookie_force] => 
    [secureredirect] => 
    [google_verification] => UOa3DCAUaJJ2C3MuUhI9eR1T9ZNzenZfHPQN4wupOE8
    [ga_account] => UA-10822215-6
    [ga_domain] => 
    [ga4_account] => G-VKDBFLKL51
    [gtm_id] => 
    [gt_code] => 
    [kontrola_pred] => 
    [omezeni] => 
    [pozadi1] => 883MLsrPT8rMz8lPz0wFAA.jpg
    [pozadi2] => 
    [pozadi3] => 
    [pozadi4] => 
    [pozadi5] => 
    [robots] => 
    [htmlheaders] => 
    [newurl_domain] => 'biomikro.vscht.cz'
    [newurl_jazyk] => 'cs'
    [newurl_akce] => '[cs]'
    [newurl_iduzel] => 
    [newurl_path] => 8548/29628/29629
    [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
    [iduzel] => 29629
    [platne_od] => 31.10.2023 17:01:00
    [zmeneno_cas] => 31.10.2023 17:01:37.080471
    [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
    [canonical_url] => 
    [idvazba] => 37730
    [cms_time] => 1713244519
    [skupina_www] => Array
        (
        )

    [slovnik] => stdClass Object
        (
            [logo_href] =>  /
            [logo] => 
            [logo_mobile_href] =>  /
            [logo_mobile] =>  
            [google_search] => 001523547858480163194:u-cbn29rzve
            [intranet_odkaz] => https://intranet.vscht.cz/
            [intranet_text] => Intranet
            [mobile_over_nadpis_menu] => Menu
            [mobile_over_nadpis_search] => Hledání
            [mobile_over_nadpis_jazyky] => Jazyky
            [mobile_over_nadpis_login] => Přihlášení
            [menu_home] => Domovská stránka
            [paticka_mapa_odkaz] => 
            [paticka_budova_a_nadpis] =>  BUDOVA A
            [paticka_budova_a_popis] => Rektorát, oddělení komunikace, pedagogické oddělení, děkanát FCHT, centrum informačních služeb
            [paticka_budova_b_nadpis] =>  BUDOVA B
            [paticka_budova_b_popis] =>  Věda a výzkum, děkanát FTOP, děkanát FPBT, děkanát FCHI, výpočetní centrum, zahraniční oddělení, kvestor
            [paticka_budova_c_nadpis] =>  BUDOVA C
            [paticka_budova_c_popis] => Dětský koutek Zkumavka, praktický lékař, katedra ekonomiky a managementu, ústav matematiky
            [paticka_budova_1_nadpis] =>  NÁRODNÍ TECHNICKÁ KNIHOVNA
            [paticka_budova_1_popis] =>  
            [paticka_budova_2_nadpis] =>  STUDENTSKÁ KAVÁRNA CARBON
            [paticka_budova_2_popis] =>  
            [paticka_adresa] =>  VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

[paticka_odkaz_mail] => mailto:Tereza.Kobzova@vscht.cz [zobraz_desktop_verzi] => zobrazit plnou verzi [aktualizovano] => Aktualizováno [autor] => Autor [drobecky] => Nacházíte se: VŠCHT PrahaFPBTÚstav biochemie a mikrobiologie [den_kratky_3] => st [novinky_kategorie_1] => Akce VŠCHT Praha [novinky_kategorie_2] => Důležité termíny [novinky_kategorie_3] => Studentské akce [novinky_kategorie_4] => Zábava [novinky_kategorie_5] => Věda [novinky_archiv_url] => /novinky [novinky_servis_archiv_rok] => Archiv z roku [novinky_servis_nadpis] => Nastavení novinek [novinky_dalsi] => zobrazit další novinky [novinky_archiv] => Archiv novinek [den_kratky_5] => pá [preloader] => Prosím počkejte chvíli... [den_kratky_1] => po [archiv_novinek] => [nepodporovany_prohlizec] => [zobraz_mobilni_verzi] => [social_yt_odkaz] => [social_fb_odkaz] => https://www.facebook.com/mikrobio320 [social_tw_odkaz] => [social_fb_title] => facebook stránka ústavu [social_tw_title] => [den_kratky_4] => [social_in_odkaz] => [den_kratky_2] => [novinka_publikovano] => Publikovano: [novinka_datum_konani] => Datum konani: [novinky_servis_kategorie_vse] => vše [novinky_servis_archiv_submit] => Filtrovat [hledani_nadpis] => hledání [hledani_nenalezeno] => Nenalezeno... [hledani_vyhledat_google] => vyhledat pomocí Google [den_kratky_0] => [social_li_odkaz] => [more_info] => [dokumenty_kod] => [dokumenty_nazev] => [dokumenty_platne_od] => [dokumenty_platne_do] => [den_kratky_6] => ) [poduzel] => stdClass Object ( [29704] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [29708] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 29708 [canonical_url] => //biomikro.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [29709] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 29709 [canonical_url] => //biomikro.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [29710] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 29710 [canonical_url] => //biomikro.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [iduzel] => 29704 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [29705] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [72638] => stdClass Object ( [nazev] => Akce Běstvina [seo_title] => Akce Běstvina [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Výjezdní studentská konference Běstvina

O co jde?

Studentské konference na Běstvině (dříve na mlejně) se aktivně a více-méně povinně v rámci předmětů „Prezentace odborného projektu“ účastní studenti 1. ročníku magisterských studijních oborů Biochemie a buněčná biologie, Mikrobiologie a genové inženýrství a Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví. Na této konferenci mají studenti možnost vyzkoušet si prezentaci výsledků svých vědeckých projektů v rámci diplomové práce před širším publikem. Toto publikum je však nanejvýš shovívavé, neboť je z velké většiny tvořeno spolužáky. V obecenstvu je též zpravidla přítomno i několik zkušenějších kolegů z řad doktorandů, doktorů, docentů či dokonce profesorů.

Kde se konference koná?

Výjezdní studentská konference se koná v táborové základně blízko malé vesničky Běstvina (49.8325517N, 15.5812344E), kterou VŠCHT získala v roce 2019. Ta se nachází v podhůří Železných hor, asi 30 km jižně od Pardubic (více informací zde). Oproti mlýnu, ve kterém se studentská konference konala dříve, oplývá základna především velkou ubytovací kapacitou, ale je zde též několik sportovišť (fotbalové, basketbalové či volejbalové hřiště a další; vybavení bude k dispozici na místě), několik ohnišť, klubovna a rozlehlá společenská místnost. Zajímavostí je, že se právě zde pravidelně odehrává Letní odborné soustředění mladých chemiků a biologů čili odborné soustředění nejúspěšnějších řešitelů krajských kol chemické a biologické olympiády.

Výhodou tohoto umístění je bezesporu krásné prostředí, ale též izolace od okolního světa, která velkou měrou přispívá ke sblížení spolužáků. K tomu může dojít při hraní deskových her či při společném dovádění na hudební nástroje (kdo umí, ať si doveze), anebo při sportovním vyžití. Nevýhodou by se mohla zdát relativní vzdálenost základny od restauračních zařízení, které sbližování též napomáhají, ale i v tomto směru nabízí pořadatelé akce jisté možnosti… (půllitr s sebou!)

Organizace

Příjezd a odjezd

Konference začíná v následujícím pondělí po magisterkých státnicích, což většinou vychází na druhý až třetí týden v červenci. Odjezd autobusu od budovy B VŠCHT je naplánován na 8:30. Dle zájmu je možné objednat k autobusu přívěs na kola. Účastnící preferující dopravu po vlastní ose nechť kontaktují organizátory (základna je vybavena parkovištěm pro větší počet vozů).

Na první den je naplánována exkurze do jednoho z biotechnologických objektů po cestě nebo okolí. Na táborovou základnu tak dorazíme v odpoledních hodinách. Večeři první den tradičně zajistí starší kolegové a kolegyně.

Podle množštví účstníků akce trvá do soboty nebo neděle. Odjezd probíhá po vlastní ose. Nejbližší vlaková stanice se nachází v obci Třemošnice, odkud je to na základnu zhruba 6 km. V případě vysokokapacitních zavazadel a hromadného dojezdu je možné povolat motorizovanou jednotku, která s převozem zavazadel pomůže. Z Běstviny se ale také můžete dostat přímým autobusem do Pardubic. Vášniví cyklisté též mohou vyrazit na kole po vlastní ose, například do Čáslavi nebo do Pardubic.

Možnosti předčasného odjezdu jsou omezené a záleží na zařazení do přednáškové sekce. Plánování přednáškových sekcí probíhá přímo před začátkem konference dle účasti starčích kolegyň a kolegů, kteří působí jako chairs jednotlivých sekcí.

Konference

Hlavním programem jsou prezentace studentských vědeckých projektů, které se již za rok promítnou do diplomových prací. Přednášky zpravidla nejsou časově omezeny, ale obvyklý rozsah je cca 20 min. Podle počasí je jeden den v týdnu vyhrazen pro celodenní výlet, většinou se organizovaně jde na blízkou sečskou přehradu, kde je možné i koupání, anebo po vlastní ose.

Absolutně nutné je přivézt si sebou nejlépe již hotovou prezentaci ve standardních formátech (ppt, pptx, pdf...). Na základně je samozřejmě zaveden elektrický proud (i v chatičkách) a dokonce je vybavena i funkční wifi, ale trávení večerů v chatičkách doděláváním prezentace vás může ochudit o spoustu zajímavých zážitků.

Spaní

Studenti budou zřejmě organizováni do chatiček, nejčastěji po dvou osobách, které budou vybaveny čistě povlečenou matrací. V táboře je monost získání dek s povlečením, nicméně je lepší si pro jistotu  přibalit spacák či jiné spací propriety. Doporučujeme též dovézt si i teplejší oblečení, protože červnové noci (a někdy i dny) bývají ještě studené.

Jídlo

Jedním z nezapomenutelných zážitků spojených s konferencí ve mlejně bylo vaření. Na mlejně si totiž účastníci vařili sami a vařit pro zhruba 60 strávníků bylo v na jednom sporáku nebylo nic snadného. Na Běstvině je tradice společného vaření zachována, avšak místní kuchyně je dimenzována pro více než 150 strávníků. Kuchyně je kvalitně vybavena konvektomatem, restaurační myčkou na nádobí, řadou varen a sporáků a různými dalšími vymoženostmi. O první společnou nedělní večeři, ale též pondělní snídani se postará starší osazenstvo, proto se v případě náročnějších strávníků stačí vybavit větší svačinou. O další jídlo pro všechny se již starají sami studenti, kteří si na každý den volí službu. V kuchyni není problém si kdykoliv udělat čaj nebo kávu. Nákupy se řeší operativně, nejbližší větší obchod je v Třemošnici (Penny market). Na společné jídlo se všichni skládají, takže je nutné se vybavit přiměřeným kapesným. Dle zkušeností z minulých let se celkový příspěvek na jídlo se vejde do 500 Kč. Speciální strava (vegetariáni, lepek, sportovci) v minulých letech nikdy nebyla problém.

Ostatní vybavení

Vřele doporučujeme si dále přibalit repelent (klíšťat je všude dost), hudební nástroj (pokud na nějaký hrajete), deskové a jiné hry a půllitr. Na této konferenci je totiž již tradicí mít k dispozici čepované pivo. Ostatní pitný režim si zajišťuje každý sám.

Volný den

V nabitém přednáškovém týdnu je též nutné najít čas na regeneraci namáhaných mozkových buněk. Proto je do týdenního programu zařazen též volný den, který je věnován aktivnímu odpočinku.

 

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 72638 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /bestvina [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_galerie [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73334] => stdClass Object ( [nazev] => Intranet ÚBM [seo_title] => Intranet ÚBM [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] => [urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 73334 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /intranet [sablona] => stdClass Object ( [class] => boxy [html] => [css] => [js] => $(function() { setInterval(function () { $('*[data-countdown]').each(function() { CountDownIt('#'+$(this).attr("id")); }); },1000); setInterval(function () { $('.homebox_slider:not(.stop)').each(function () { slide($(this),true); }); },5000); }); function CountDownIt(selector) { var el=$(selector);foo = new Date; var unixtime = el.attr('data-countdown')*1-parseInt(foo.getTime() / 1000); if(unixtime<0) unixtime=0; var dnu = 1*parseInt(unixtime / (3600*24)); unixtime=unixtime-(dnu*(3600*24)); var hodin = 1*parseInt(unixtime / (3600)); unixtime=unixtime-(hodin*(3600)); var minut = 1*parseInt(unixtime / (60)); unixtime=unixtime-(minut*(60)); if(unixtime<10) {unixtime='0'+unixtime;} if(dnu<10) {unixtime='0'+dnu;} if(hodin<10) {unixtime='0'+hodin;} if(minut<10) {unixtime='0'+minut;} el.html(dnu+':'+hodin+':'+minut+':'+unixtime); } function slide(el,vlevo) { if(el.length<1) return false; var leva=el.find('.content').position().left; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; var cislo=leva/sirka*-1; if(vlevo) { if(cislo+1>pocet) cislo=0; else cislo++; } else { if(cislo==0) cislo=pocet-1; else cislo--; } el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka}); el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected'); el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected'); return false; } function slideTo(el,cislo) { if(el.length<1) return false; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; if(cislo<0 || cislo>pocet) return false; el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka}); el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected'); el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected'); return false; } [autonomni] => 1 ) ) [73018] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 73018 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /akce [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67241] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67241 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /SVK [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67203] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => Pseudocronobacter [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Main spectrum projections of "pseudo-Cronobacter" strains from the article B. Svobodová, J. Vlach, P. Junková, L. Karamonová, M. Blažková & L. Fukal: Novel Method for Reliable Identification of Siccibacter and Franconibacter Strains: from “Pseudo-Cronobacter” to New Enterobacteriaceae Genera. Applied and Environmental Microbiology 83(13) e00234-17. DOI: 10.1128/AEM.00234-17.

EB29_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB31_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB32_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB33_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB35_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB38_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB39_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB41_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB42_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB44_Siccibacter_turicensis_MspExport.btmsp
EB45_Siccibacter_turicensis_MspExport.btmsp

Also available at Zenodo

DOI
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67203 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /pseudocronobacter [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [66832] => stdClass Object ( [nazev] => Sbírka mikroorganismů [seo_title] => Sbírka mikroorganismů [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Seznam mikroorganismů sbírky ÚBM naleznete na adrese https://web.vscht.cz/~savickad/ (dostupné z domény vscht.cz).

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 66832 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/66832 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [65263] => stdClass Object ( [nazev] => [ikona] => [autor] => [kod] => [platne_od] => [platne_do] => [keywords] => [popis] =>

Aktuální problematika mikrobiologie potravin 2022

[iduzel] => 65263 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/konference [sablona] => stdClass Object ( [class] => dokument [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [62131] => stdClass Object ( [nazev] => SVK 2021 - Výherci [seo_title] => SVK2021 [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Sekce

1. místo

2. místo

3. místo

Cena sponzora

Produkce a studium proteinů

Bc. Aneta Machalíková

Bc. Simona Galádová

Bc. Ľubomíra Papíková

Bc. Tereza Volfová

Bc. Blanka Husťáková

Biomedicínské aplikace

Bc. Jana Psotová

Bc. Adéla Vávrová

Bc. Kateřina Kuglerová

Zdeněk Míchal

Bc. Kateřina Bašusová

Bioanalytické metody a jejich aplikace

Bc. Filip Souček

Bc. Tereza Vodičková

Bc. Barbora Zapletalová

Bc. David Straka

Interakce v biologických systémech

Bc. Michaela Čermáková

Bc. Karolína Štrbová

Bc. Jan Beránek

Bc. Veronika Tomšovská

Vliv malých molekul na metabolismus

Bc. Jana Bláhová

Bc. Tomáš Nejedlý

Bc. Irena Jochovičová

Bc. Mária Goliašová

Mikrobiologie

Bc. Michaela Kubáňová

Bc. Barbora Chylíková

Bc. Manuela Tadrosová

Bc. Monika Jiráčková

Genetika

Bc. Veronika Liščáková

Bc. Jan Šnábl

Bc. Kateřina Hanáková

Bc. Denisa Nováková

Všem umístěním gratulujeme! Sborník všech příspěvků si můžete stáhnout zde.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 62131 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/62131 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [42959] => stdClass Object ( [nazev] => Akce Mlejn [seo_title] => Akce Mlejn [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Výjezdní studentská konference MLEJN

O co jde?

Studentské konference na mlejně se aktivně zúčastní studenti 1. ročníku magisterských studijních oborů Mikrobiologie, Obecná a aplikovaná biochemie a Laboratorní metody a příprava léčivých přípravků. Na této konferenci mají studenti možnost vyzkoušet si prezentaci výsledků svých vědeckých projektů v rámci diplomové práce před širším publikem. Toto publikum je však nanejvýš shovívavé, neboť je z velké většiny tvořeno spolužáky. V obecenstvu je též zpravidla přítomno i několik zkušenějších kolegů z řad doktorandů, doktorů, docentů či dokonce profesorů.

Konferenci předchází společná exkurze významného biotechnologického pracoviště.

mlyn1

Kde se konference koná?

Výjezdní studentská konference se koná (jak již název napovídá) ve mlýně, a to doslova. Tento vysloužilý mlýn, který svou kapacitou vyhoví právě skupince mikrobiologů, biochemiků a klinických biochemiků, se nachází uprostřed lesa poblíž vesničky Myslív blízko Nepomuku (https://en.mapy.cz/s/2oqcr). Výhodou tohoto umístění je bezesporu krásné prostředí, ale též izolace od okolního světa, která velkou měrou přispívá ke sblížení spolužáků. K tomu může dojít při hraní deskových her či při společném dovádění na hudební nástroje (kdo umí, ať si doveze) ve vnitřních prostorách mlýna, anebo při sportovním vyžití na rozlehlé zahradě a v blízkém okolí. Nevýhodou by se mohla zdát vzdálenost mlýna od restauračních zařízení, které sbližování též napomáhají, ale i v tomto směru nabízí i samotný mlýn jisté možnosti… (půlitr s sebou!)

mlyn2

Organizace

Exkurze

Akce Mlejn začíná dne 11.6. exkurzí do Plzeňského pivovaru. Sraz bude v 7:30 před VŠCHT odkud bude odjíždět přistaveným autobusem v 8:00. Součástí exkurze je dobrovolná degustace piva v ceně 100 Kč na osobu.

Konference

Po exkurzi (někdy kolem poledne) následuje přesun na místo pobytu, jímž je mlýn u obce Myslív blízko Nepomuku (souřadnice 49⁰ 25' 50.262“ N 13⁰ 35' 15.167“ E, 49.430628, 13.587546, https://en.mapy.cz/s/2oqcr). V následujících dnech budou hlavním programem prezentace vašich vědeckých projektů. Přednášky zpravidla nejsou časově omezeny, ale obvyklý rozsah je cca 15 min. Podle počasí je jeden den v týdnu vyhrazen pro celodenní výlet, buď na kole, nebo pěšky. Akce končí v neděli 17.6. individuálním přesunem domů. Možnosti předčasného odjezdu jsou omezené a záleží na zařazení do přednáškové sekce. Plánování přednáškových sekcí probíhá přímo před začátkem konference.

mlyn3

Standardní harmonogram:

8:00 - 9:00

snídaně

9:00 - 10:30

dopolední sekce I

10:30 -11:00

coffee break

11:00 - 12:30

dopolední sekce II

13:00

oběd

16:00 - 17:30

odpolední sekce I

17:30 - 18:00

coffee break

18:00 - 19:30

odpolední sekce II

20:00

večeře


Doprava

Pokud se chystáte jet vlastním autem, neměl by to být problém, prosíme ale, abyste sdělili tuto skutečnost předem (na spiwokv@vscht.cz). Kolo je velmi vítané na celodenní výlet, každodenní vyjížďky po okolí, případně i cestu domů. Autobus, který nás poveze na exkurzi, bude vybaven přívěsem na kola (prosíme o sdělení počtu cyklistů a cyklistek na spiwokv@vscht.cz).

mlyn4

Povinné vybavení a další informace

Spaní

Přestože mlejn oplývá kapacitou pro ubytování kolem šedesáti lidí, nenabízí spaní na posteli či matraci zdaleka pro každého. Je proto nutné vybavit se kompletem pro spaní na podlaze (karimatka, spacák). Doporučujeme též dovézt si i teplejší oblečení, protože červnové noci (a někdy i dny) bývají ještě studené.

mlyn5

Prezentace

Absolutně nutné je přivézt si sebou nejlépe již hotovou prezentaci ve standardních formátech (ppt, pptx, pdf..). V mlejně je samozřejmě zaveden elektrický proud a dokonce je vybaven i funkční wifi, ale trávení večerů na pokoji doděláváním prezentace vás může ochudit o spoustu zajímavých zážitků.

Jidlo

Jedním z nezapomenutelných zážitků spojených s konferencí ve mlejně je místní vaření. Na mlejně si totiž účastníci vaří sami. No a vařit pro zhruba 60 strávníků není v místních podmínkách nic snadného. Přesto nás (myšleno starší účastníky) každý rok překvapí, jaké kulinářské zážitky jsou schopni studenti zajistit. O první společnou večeři v pondělí i oběd v úterý se většinou postará starší osazenstvo, proto se stačí vybavit větší svačinou pro případ, kdyby se nestíhal pondělní oběd v Plzni po exkurzi. V dalších dnech se o vaření starají již sami studenti, kteří si na každý den volí službu. Nákupy se řeší operativně, nejbližší obchod je v Myslívě, avšak nejčastěji je jezdí s hromadným seznamem do Nepomuku. Na společné jídlo se tedy všichni skládáme, takže je nutné se vybavit přiměřeným kapesným. Dle zkušeností z minulých let však chceme upozornit, že celkový příspěvek na jídlo se vejde do 400 Kč. Vždy ale záleží na nárokách a invencích daného ročníku.

mlyn6

Ostatní vybavení

Vřele doporučujeme si dále přibalit repelent (klíšťat je všude dost), hudební nástroj (pokud na nějaký hrajete), deskové a jiné hry a půllitr. Na mlejně je totiž již tradicí mít k dispozici čepované pivo. Ostatní pitný režim si zajišťuje každý sám.

mlyn7

Volný den

V nabitém přednáškovém týdnu je též nutné najít čas na regeneraci namáhaných mozkových buněk. Proto je do týdenního programu zařazen též volný den, který je věnován aktivnímu odpočinku. Zde jen pár možností, co se dá podnikat v okolí mlejna:

Cyklovýlet

Pod vedením cyklistického guru Vojty Spiwoka je možné zúčastnit se celodenního výletu směr Horažďovice, Rábí a zpět, který je vhodný pro horská, krosová a s malou objížďkou i silniční kola (https://en.mapy.cz/s/2oqhV).

Angusfarma

Velmi oblíbenou variantou je též pěší výlet za nevšedním gurmánským zážitkem na Angusfarmu do blízkých Soběsuk (https://www.angusfarm.cz/).

Techmania Science Centre v Plzni

Zajímavou variantou je výlet do vědecko-technického centra v Plzni (http://techmania.cz/cs/).

Koupání v lomu

Nedaleko mlýna se nachází zatopený lom s průzračně čistou vodou. Pokud je počasí nakloněno, je koupačka v lomu velmi příjemnou záležitostí.

mlyn8

Proč to všechno?

Motivací, proč pořádáme výjezdní studentskou konferenci ve mlejně, je hned několik. Přínosem je pro studenta nejen možnost vyzkoušet si prezentovat své výsledky před širším publikem, ale především povinnost se po roce bádání zastavit a sesumírovat si všechny dosavadní výsledky i již plánované další postupy. V rámci diskuze po prezentaci se pak sám dozví, zda je schopen získané výstupy či navržené postupy obhájit, popřípadě jak postupovat, aby to se mu to povedlo lépe. Velmi cenný je též nezávislý pohled ostatních zkušenějších kolegů přítomných v obecenstvu, kteří velmi rádi poskytují své zkušenosti v oboru. Prosíme studenty, aby nechápali diskuzi po prezentaci jako nutné zlo, ale spíše jako možnost konstruktivně probrat řešení různých zádrhelů, se kterými se během vypracovávání své diplomové práce setkává každý student.

Co se týče osobního úhlu pohledu, je mlejnská sešlost výbornou šancí, jak se lépe seznámit se spolužáky i se zkušenějšími pracovníky z ústavu. Dobré kontakty získané během studia na vysoké škole mohou být totiž velmi výhodné i během další kariéry. Studentská konference ve mlejně je navíc již léty prověřená akce a její efekt na sbližování lidí byl experimentálně prověřen jako velmi pozitivní.

mlyn9

[urlnadstranka] => [iduzel] => 42959 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/42959 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [42630] => stdClass Object ( [nazev] => Zkušební laboratoř ÚBM FPBT VŠCHT Praha [seo_title] => Akreditovaná laboratoř [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Laboratoř je akreditována podle ČSN EN ISO/IEC 17025:2018 Českým institutem pro akreditaci o.p.s. jako zkušební laboratoř č. 1316.3

Činnost ZL ÚBM je rozdělena do dvou laboratoří:

  •  Laboratoře mikrobiologie 
  •  Laboratoře geneticky modifikovaných organismů (GMO)

Laboratoř mikrobiologie:

Mikrobiologické analýzy potravin 

  • Stanovení celkového počtu mikroorganismů v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU*
  • Horizontální metoda průkazu a stanovení Listeria monocytogenes v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Stanovení počtu kvasinek a plísní v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Horizontální metoda průkazu bakterií rodu Salmonella v potravinách, pokrmech,krmivech  a PBU
  • Stanovení počtu koagulázopozitivních stafylokoků v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Stanovení počtu Listeria monocytogenes v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Horizontální metody pro průkaz a stanovení bakterií čeledi Enterobacteriacae potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Stanovení počtu β-glukuronidázopozitivních Escherichia coli v potravinách, pokrmech, krmivech  a PBU
  • Stanovení počtu presumptivního Bacillus cereus v potravinách, potravinářských surovinách a   krmivech
  • Stanovení počtu bakterií r.Lactobacillus v potravinách a pomrmech, potravinových doplňcích

* PBU   předměty běžného užívání

 Mikrobiologické analýzy pitné vody, balené vody  v plném rozsahu platné legislativy

  • Stanovení indikátorů fekálního znečištění (fekální streptokoky, Escherichia coli a koliformní bakterie)
  • Stanovení kultivovatelných mikroorganismů při 22 °C a 36 °C 
  • Stanovení Clostridium perfringens 

Mikrobiologické analýzy balených vod, bazénové vody

  • Stanovení  kultivovatelných mikroorganismů při 36 °C
  • Stanovení  počtu koagulázopozitivních stafylokoků
  • Stanovení  počtu Escherichia coli
  • Stanovení  počtu  Pseudomonas aeruginosa

Stanovení  mikrobiální kontaminace 

v prostředí potravinářských provozoven a komunálních budov

Mikrobiologická analýza ovzduší

  • Stanovení celkové koncentrace směsné populace plísní
  • Stanovení celkové koncentrace směsné populace plísní

Kosmetika, kosmetické a zdravotnické přípravky

  • Průkaz mikroorganismů sledovaných v kosmetických produktech a zdravotnických přípravcích
  • Zkouška účinnosti konzervace zátěžovým testem

Identifikace mikroorganismů metodou hmotnostní spektometrie MALDI-TOF

Laboratoř geneticky modifikovaných organismů (GMO):

  • Důkaz a kvantifikace GMO metodou PCR v potravinářských surovinách, potravinách a krmivech
  • Kvantifikace GMO metodou real-time PCR v potravinářských surovinách, potravinách a krmivech

Pracoviště GMO je zařazeno do seznamu laboratoří s oprávněním vykonávat činnost kontroly přítomnosti a kvantifikace transgenů v povoleném rozsahu pro Ministerstvo životního prostředí.

Kontakt:

Mikrobiologická laboratoř: Ing. Jana Kadavá, tel. +420 220 445 200

Laboratoř GMO: Ing. Kamila Zdeňková, PhD., tel. +420 220 445 196

Kontakty na akreditovanou Metrologickou a zkušební laboratoř VŠCHT pro chemické analýzy naleznete ZDE.

Osvědčení:

Recenze:

ZL ÚBM se vedle akreditovaných laboratorních analýz významně podílí na spolupráci se subjekty (zákazníky) v oblasti vzdělávání. Je pořadatelem řady odborných kurzů v oblasti mikrobiologie, které jsou vždy organizovány v souladu s potřebami zákazníků. Kurzy probíhají vždy ve 2 částech – teoretická a praktická v posluchačských laboratořích.

Členové týmu laboratoře se jako experti velmi aktivně podílí i na vzdělávání mikrobiologických pracovníků potravinářských laboratoří ze/v zahraničí – např.  Saudská Arábie, přednášky a a  laboratorní kurzy. Tyto kurzy jsou zaměřeny na detekci patogenů v potravinách. Současně se podle požadavků zákazníka věnují i zavádění nových metod a jejich validaci (pravidelné kursy pro evropské a africké mikrobiology a manažery firmy Coca Cola)

Dále populární formou organizujeme i výukové kurzy pro studenty středních škol v rámci rozšíření jejich znalostí v oblasti přírodních věd, zejména v oblasti mikrobiologie potravin.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 42630 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /akreditovana-lab [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [39517] => stdClass Object ( [nazev] => Geneticky modifikované organismy [seo_title] => Geneticky modifikované organismy [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Nakládání s geneticky modifikovanými organismy:

Informace pro zaměstnance Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha a studenty

Havarijní plán Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha pro práci s GMO (zkrácená verze)

Odborný poradce: prof. Ing. Kateřina Demnerová, CSc.

Osoby odpovědné za likvidaci havárie v jednotlivých laboratořích:

Plán pracoviště: Plánek bude všem dodán, hlavní je vědět, kde je hlavní uzávěr vody, elektřiny a plynu pro každou laboratoř!!!

Plán s označením hlavních ovladačů přívodu energií a bezpečnostními prvky je nedílnou součástí tohoto Havarijního plánu a je zahrnut jako Příloha 5; 5a a 5b.

V případě požáru bude vypnut hlavní přívod elektřiny a plynu (vyznačeno na plánku rozmístění laboratoří) a dle rozsahu požáru bude zvolen způsob hašení (pěnové hasící přístroje, voda). Pracovníci jsou povinni řídit se interním požárním řádem VŠCHT Praha. Při likvidaci požáru bude zohledněna práce s GMO a dle potřeby a situace bude pracoviště následně ošetřeno desinfekčním prostředkem (chlornan sodný 0,5-1%, Ajatin 0,5-2%).

V případě poškození vodovodního řadu a vytopení laboratoře bude nejdříve uzavřen hlavní přívod vody (viz plánek Příloha 5; 5a a 5b), kultury GMO budou přeneseny do jiného uzavřeného prostoru a prostor bude přiměřeně asanován a vysušen. Při současném úniku GMO do prostředí budou použity desinfekční prostředky a po ukončení asanace bude sledována přítomnost transgenů nebo jejich produktů metodami uvedenými v bodě j) tohoto Havarijního plánu.

Při úniku GMO zařazených do těchto kategorií, v uzavřeném prostoru i mimo něj nehrozí bezprostřední ohrožení zdraví lidí ani ohrožení životního prostředí a GMO je možno likvidovat postupem v laboratoři běžným (autoklávování 121 °C, 0,15 MPa, 50 min, použití desinfekčních prostředků). Za havárie ve vlastním slova smyslu se NEPOVAŽUJÍ malé úniky GMO (několik mililitrů), při nichž uniklé GMO mohou být rychle a spolehlivě zlikvidovány použitím desinfekčních prostředků. Za havárii je nutno považovat rozšíření GMO mimo laboratoře (chodby), určené k uzavřenému nakládání s GMO.

Při přenosu nádob s transgenním materiálem např. z kultivační místnosti do laboratoře může dojít k rozlití většího objemu této kultury (např. 1 litr). Zasažená místa je nutné s použitím ochranných rukavic vysušit, odpad zlikvidovat autoklávováním a místo ošetřit v dostatečném rozsahu dvěma typy desinfekčních roztoků: např. Ajatinem (0,5-2%) a následně chlornanem sodným (0,5-1%).Všichni musí vědět, kde v laboratoři je ajatin a Chlornan sodný (SAVO).

Potřeby pro kultivaci rostlin je třeba mýt v roztoku chlornanu v plastové vaně. Po 24 hod. stání je možno roztok zlikvidovat vylitím do komunálního odpadu.

Při rozšíření semen (desítky kusů) nebo vegetativních částí, schopných samostatného rozmnožování, je třeba především zabránit možnosti odnesení částí rostlin na obuvi apod. Dále je nutné asepticky odklidit pevné části do plastového pytle a sterilovat autoklávováním a zasažené místo pak ošetřit desinfekčním prostředkem tak, jak je uvedeno výše.

V případech havárie odlišné od zde popsaných je nutno postupovat podle pokynů odborného poradce.

V případě havárie bude informován odborný poradce, vedoucí ÚBM a děkan fakulty.

Přenos kultur 

Při přenosu kultur GMO z kultivačních místností do laboratoří bude situace řešena v závislosti na objemu kultury. Malé objemy budou přenášeny v plastikových uzavřených obalech, velké objemy v přepravkách překrytých alobalem. Podobně při přenášení kultur a materiálu z laboratoří k likvidacím autoklávováním do k tomu určené místnosti B250 budou malé objemy, kultury na plotnách nebo použité plasty přenášeny v plastikových uzavřených obalech s piktogramem Biohazard, větší objemy v uzavřených lahvích a baňkách jištěných v přepravce a překrytých folií. Přenášený a převážený rostlinný materiál bude neprodyšně uzavřen v plastových nebo plechových nádobách (obalech) a označen značkou Biohazard nejméně 5 cm velkou na protilehlých stranách. Pokud bude materiál přepravován vozem, automobil bude označen nápisem Biohazard a v autě bude k disposici popis přepravovaného materiálu a obecné instrukce, jak postupovat s uzavřeným kontejnerem obsahujícím transgenní materiál (neotvírat, dopravit na ÚBM VŠCHT Praha). Vědečtí pracovníci mají k dispozici genové mapy a sekvence insertů, s nimiž pracují a v případě úniku lze těchto znalostí využít pro monitorování případného úniku transgenu a následnou likvidaci a asanaci.

Likvidace

V případě úniku geneticky modifikovaných mikroorganismů a rostlin bude vymezen zasažený prostor, výrazně označen a ohraničen (křídou, fixem, výstražné nápisy) a bude zamezen přístup osob. Prostor bude ošetřen 0,5-1% chlornanem sodným a následně 0,5-2% Ajatinem. Po chemické asanaci se kontaminovaná plocha ozáří germicidní lampou výkon 2x25W. Jednotlivé drobné předměty, které byly únikem zasaženy, budou autoklávovány. Transgenní rostliny, které by unikly mimo vymezené bariéry, budou smeteny a autoklávovány v pytlích. Nepřítomnost geneticky modifikovaných mikroorganismů bude dokumentována odebráním vzorků z původně zasaženého místa a průkazem nepřítomnosti GMO nebo jejich produktů. (Smotkem gázy navlhčeným sterilní vodou bude setřeno cca 50x50 cm plochy, gáza eluována malým množstvím vody a bude použita buď jako templát pro PCR s použitím primérů odvozených od sekvence insertu nebo k imunochemické detekci produktů transgenů.) Toto je i postup pro přípravu pro sledování GMO, když se vede deník.

Popis a nákres uložení asanačních prostředků použitelných ke zneškodnění

Koncentrovaný a naředěný roztok (0,5-1%) chlornanu sodného a koncentrovaný a naředěný roztok (0,5-2%) Ajatinu budou umístěny v označených skříních umístěných ve všech místnostech určených pro uzavřené nakládání s GMO.

V případě havárie budou ihned vyrozuměni telefonicky event. emailem vedoucí pracoviště, osoby zodpovědné za likvidaci havárie jmenovitě uvedené v bodě d) tohoto Havarijního plánu a odborný poradce a bude zajištěna okamžitá dekontaminace.

Provozní plán Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha pro práci s GMO

Kategorie rizika nakládání s geneticky modifikovaným organismem, které smí být na pracovišti prováděno: Kategorie rizika I a II.

Seznam pracovníků proškolených pro práci s GMO na pracovišti

V Provozním řádu, který vám bude dodán, jsou doplněni pracovníci ÚBM a PGS studenti. Každá laboratoř přidá k Provoznímu řádu seznam studentů (magistři a bakaláři) aktuálně pracujících v laboratoři.

Povinnosti pracovníků při práci

Stávající pracovníci a PGS studenti uvedení v seznamu pro jednotlivé laboratoře byli proškoleni na provádění všech metod uvedených v odstavci g) Provozního řádu. Za dodržování pracovních postupů v jednotlivých laboratořích jsou zodpovědní příslušní vedoucí laboratoří. Školení budou pravidelně opakována.

Po ukončení práce v laboratoři mají pracovníci povinnost zajistit bezpečné uložení biologického materiálu s transgenní DNA, otřít pracovní plochu chemickou desinfekcí (např. 0,5-1% roztokem chlornanu sodného). Použitý materiál s GMO určený k likvidaci bude sterilován v autoklávu 50 minut při 121 °C, přetlak 0,15 MPa. Postup dekontaminace nástrojů při ukončení pracovní činnosti se řídí podle charakteru činnosti a určuje jej vedoucí laboratoře. Ochranné oděvy kontaminované geneticky modifikovanými mikroorganismy se budou prát jako infekční materiál: samostatný sběr a oddělená izolovaná přeprava.

Systém a četnost kontrol prostoru, zařízení a ochranných opatření

Kontroly čistoty pracovních ploch budou prováděny pověřenými proškolenými pracovníky s četností 1krát za 6 měsíců s platností od října 2016 (do září 2016 3krát ročně): stěry - sledování výskytu používaných mikroorganismů a pomocí PCR metody bude detekován příslušný transgen. U autoklávů určených pro likvidaci GMO (místnost B250 a BY12) budou pravidelně kontrolovány předepsané parametry pro bezpečnou sterilizaci externími servisními techniky a zaprotokolovány v provozní knize přístroje. Lednice a mrazáky určené pro uchovávání GMO jsou bezpečně uzamčeny a klíče jsou k dispozici u vedoucího příslušné laboratoře. Možnost výskytu přenašečů GMO (hmyz, hlodavci) je vyloučena zajištěním laboratoří, jejichž dveře a okna jsou trvale uzamčené nebo opatřené koulí. Laboratoře jsou klimatizované, okna jsou proti vniknutí hmyzu zajištěna síťkami. Zápis v Knize kontrol o každé kontrole bude parafován vedoucím příslušné laboratoře, odborným poradcem a vedoucím příslušné katedry.

Zásady vedení pracovních protokolů

Každá činnost s GMO je zaznamenávána do pracovních protokolů každého pracovníka s vyznačením čísel stránek, data zápisu a poznámkou o způsobu likvidace nepotřebných GMO.

Opatření k zabránění vstupu nepovolaných osob

Laboratorní prostory jsou rozděleny na funkční jednotky. Do každé jednotky je možný vstup pouze jedněmi dveřmi otevíratelnými klíčem. Klíče mají pracovníci, kteří v jednotce pracují. Studenti VŠCHT Praha mají do nich přístup pouze ve speciálních pláštích označených značkou Biohazard, které jsou nošeny pouze v těchto prostorách.

Přílohy:

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 39517 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /gmo [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29714] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => Domovská stránka Ústav biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] => [urlnadstranka] => [obrazek] => [iduzel] => 29714 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_novinky [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [39110] => stdClass Object ( [odkaz] => http://old-biomikro.vscht.cz/vyuka [iduzel] => 39110 [canonical_url] => //biomikro.vscht.cz/vyuka [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyuka [sablona] => stdClass Object ( [class] => redirect [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29727] => stdClass Object ( [nazev] => O ústavu [seo_title] => O ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Posláním Ústavu biochemie a mikrobiologie je pedagogická a výzkumná činnost v oblastech biochemie, mikrobiologie, biologie a molekulární genetiky. Ústav zajišťuje výuku základních kurzů těchto disciplín v bakalářském studiu pro celou Fakultu potravinářské a biochemické technologie. Řada specializovaných předmětů je vyučována v navazujícím studiu magisterském a doktorském. Do výzkumných projektů cílevědomě zapojujeme posluchače všech stupňů studia v rámci řešení úkolů bakalářských, diplomových a disertačních prací.

obrázek

[urlnadstranka] => [obrazek] => [iduzel] => 29727 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /o-ustavu [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29758] => stdClass Object ( [nazev] => Studium [seo_title] => Studium [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Ústav biochemie a mikrobiologie zajišťuje v bakalářském studiu výuku předmětů (biochemie, mikrobiologie, biologie a další) pro obory studijních programů FPBT, včetně nového oboru Forenzní analýza. Biochemie je přednášena pro studenty všech fakult VŠCHT. V magisterském studiu zajišťuje ústav výuku dvou oborů, patřících do programu Biochemie a biotechnologie, a to Mikrobiologie a Obecné a aplikované biochemie. Dále zajišťujeme výuku programu Klinická bioanalytika oboru Laboratorní metody a příprava léčivých přípravků.

V rámci těchto bakalářských a magisterských programů, buď vlastními silami, nebo ve spolupráci s dalšími pracovišti VŠCHT nebo dalšími institucemi, vyučujeme předměty z oblastí biochemie, mikrobiologie, metod biochemického výzkumu a bioanalytiky, medicínských předmětů, molekulární biologie a genového inženýrství, forenzní analýzy a biologie. Dále vyučujeme vybrané předměty v angličtině.

Ústav je akreditován pro výchovu doktorandů postgraduálního studia v oborech Biochemie a Mikrobiologie. Zájemci a zájemkyně o doktorské studium mohou kontaktovat jednotlivé laboratoře nebo sekretariát ústavu.

[urlnadstranka] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 29758 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /studium [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29759] => stdClass Object ( [nazev] => Vědecké zaměření ústavu [seo_title] => Vědecké zaměření ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Ústav biochemie a mikrobiologie rozvíjí základní výzkum v oblastech molekulární biologie retrovirů, proteomiky, biochemie, fyziologie a molekulární biologie rostlin, enzymologie, mikrobiologie životního prostředí, potravinářské mikrobiologie a bioanalytických metod. Tyto aktivity vytváří platformu pro aplikovaný výzkum cílený na vývoj moderních terapeutických přístupů, možnosti bioremediací organických a anorganických zátěží v životním prostředí a sledování hygienické kvality potravin (ústav provozuje i akreditovanou Zkušební laboratoř ústavu biochemie a mikrobiologie) či interakcí rostlin s patogeny. Výzkum je v řadě případů interdisciplinárního charakteru a vedle úzké odborné spolupráce mezi jednotlivými laboratořemi ústavu by byl nemyslitelný bez kooperace s řadou národních a zahraničních pracovišť v rámci společných výzkumných programů a projektů. Na národní úrovni se pracoviště ústavu podílí na řešení úkolů Centra aplikované genomiky a na řešení výzkumného záměru Progresivní potravinářské a biochemické technologie. Současně jsou na ústavu řešeny úkoly projektů podporovaných GA ČR, TA ČR, MPO, MŠMT.

Vědecko-výzkumné portfolio ústavu v bodech:

Oblast medicínsky orientovaného výzkumu a vývoje

  • biologie skládání retrovirových částic a struktura a buněčný transport retrovirových proteinů se zřetelem na využití modifikovaných částic pro genové terapie
  • identifikace proteinů místně deponovaných v souvislosti s aplikací implantátů nebo kalcifikací stěn srdečních chlopní a cév; biokompatibilní materiály pro kožní náhrady
  • konstrukce nanočástic cílených do nádorových buněk k zobrazení karcinomů, testování cytostatik, rostlinné nukleasy jako protinádorová terapeutika a lipidová tělíska jako nosiče cílených hydrofobních léčiv
  • účinky adipokinů a možnosti nutriční a farmakologické intervence při metabolickém syndromu
  • rostlinné a hmyzí peptidy s antimikrobiálním účinkem jako terapeutika
  • glykosidasy extrémofilů pro enzymové syntézy terapeuticky významných derivátů sacharidů
  • vývoj a aplikace nových metod molekulárního modelování a strukturní bioinformatiky

Oblast kontroly a bioremediací životního prostředí

  • metabolické konverze xenobiotik a využití mikroorganismů a rostlin pro bioremediace znečištění prostředí organickými xenobiotiky
  • genomika a metagenomika pro studium mikrobiální diverzity a genetického potenciálu se zřetelem na symbiosu mikrobiálních konsorcií a rostlin a jejich synergii v bioremediačních procesech
  • molekulární determinanty fosfolipidového signálního systému rostlin v odpovědi na biotický a abiotický stres se zvláštním zřetelem na využití mechanismů indukované rezistence v alternativní ochraně rostlin proti chorobám
  • vývoj imunochromatografických souprav pro stanovení xenobiotik a posuzování xenobiotik, jejich metabolických intermediátů a těžkých kovů z hlediska cytotoxicity, genotoxicity a fyziologického dopadu jejich ingesce
  • biochemické a molekulárně biologické aspekty (hyper)akumulace těžkých kovů velkými houbami se zvláštním zřetelem na determinanty využitelné pro fytoremediace
  • transgenní rostliny pro fytoremediace půd a sedimentů kontaminovaných organickými xenobiotiky a těžkými kovy
  • povrchová expozice vazebných peptidů pro zvýšení kapacity mikrobiálních biosorbentů těžkých kovů
  • perspektivy lipidových tělísek pro likvidace ropných havárií a snažší syntézy degradovatelných plastů

Oblast kontroly a bezpečnosti potravin

  • vývoj moderních rychlých metod záchytu a kvantifikace potravinových patogenů (detekce a kvantifikace pomocí PCR, a DNA čipů, genotypizační metody, imunochemické metody včetně vývoje imunochromatografických souprav) doplněné klasickými mikrobiologickými metodami.
  • molekulární biologie enterotoxinů Staphylococcus aureus
  • tvorba biofilmů a sledování jejich resistence vůči disinfekčním prostředkům
  • resistence vybraných potravinových patogenů k antibiotikům
  • akreditované metody a vývoj nových metod detekce a kvantifikace geneticky modifikovaných potravinových surovin a potravin
  • identifikace peptidů vážících ionty těžkých kovů v potravinových surovinách a potravinách

Oblast interakce rostlin s patogeny

  • studium rostlinné imunity
  • modelová rostlina Arabidopsis thaliana
  • interakce zemědělsky významné plodiny řepky olejky s patogenem Leptosphaeria maculans
  • PCR, měření fytohormonů, měření typických odpovědí rostlin na napadení patogeny (ROS, calosa …), symptomy (Hyaloperenospora arabidopsidis, Pseudomonas syringae, Botrytis cinerea)
[urlnadstranka] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 29759 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29883] => stdClass Object ( [nazev] => Kurzy a poradenství [seo_title] => Kurzy a poradenství [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Kromě pedagogické a vědecko-výzkumné činnosti nabízí Ústav biochemie a mikrobiologie analýzy, kurzy, semináře a poradenství pro zájemce z jiných akademických organizací nebo firem.

V připadě zájmu kontaktujte Ing. Magdalenu Melčovou

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 29883 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /kurzy [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [58857] => stdClass Object ( [nazev] => Metody a technické vybavení ústavu [seo_title] => Metody a technické vybavení ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => atom [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>

Elektoroforetické metody

  • SDS-PAGE
  • agarosová elektroforéza
  • Western blot
  • RFLP
  • kapilární elektroforéza

Centrifugace, ultracentrifugace

  • mikrotitrační destičky až 0,5l láhve, max. RCF 1 000 000

Chromatografické metody

  • FPLC
  • HPLC
  • plynová chromatografie

Dezintegrace buněk

  • enzymová
  • mechanická - OneShot

Izolace nukleových kyselin

  • DNA
  • RNA
  • mRNA
  • cDNA
  • plasmidové DNA

PCR

  • PCR
  • qPCR
  • dPCR

Stanovení aktivity enzymů

  • peroxidasa, lipasa, amylasa, cellulasa, chitinasa, galaktosidasa, glukosidsa, mannosidasa, glukuronidasa, preoteasa, trypsin, fukosidas, nukleasa, katalasa, glutathionperoxidasa, glutathionreduktasa, glutathion-S-transferasa, thioredoxinreduktasa
  • další enzymy dle dohody

Produkce rekombinantních proteinů

  • E. coli
  • S. cerevisiae
  • tkáňové kultury
  • Arabidopsis thaliana
  • BY2 buňky
  • vyšší houby

Izolace lipidových tělísek a jejich charakterizace

  • mikroskopie
  • DLS

TLC analýza

  • sacharidy
  • lipidy

Purifikace oligosacharidů

Hmotnostní spektrometrie

  • MALDI-TOF/TOF
  • LC-ESI-Q-TOF

Imunochemické metody

  • ELISA
  • imunochromatografické testy

Spektrofotometrie: měření v kyvetách i mikrotitračních destičkách

  • absorbance
  • fluorescence shora/zdola
  • luminiscence
  • time-resolved luminiscence
  • flurescenční polarizace
  • u vybraných technik použití injektorů

Biolistická transformace

  • rostlinných buněk
  • živočišných buněk
  • v intaktních organismech

Mikroskopické metody

  • Fluorescenční mikroskopie a další typy světelných mikroskopií. Mnoho různých fluoroforů, objektivů i kamer. Konfokální mikroskopie (spinning disc), superrezoluční mikroskopie. Možnost pozorování živých buněk.
  • Transmisní elektronová mikroskopie (TEM) - příprava vzorků pro elektronovou mikroskopii – CPD (critical point drying), pokovování, pouhlíkování, příprava ultratenkých řezů, negativní barvení

Mikrobiologické metody

  • kultivační a identifikační metody klasické potravinářské mikrobiologie včetně ISO metod
  • identifikace mikroorganismů metodou MALDI-TOF MS
  • detekce a identifikace potravinářsky významných mikroorganismů pomocí PCR
  • kultivační stanovení fenotypové rezistence k antibiotikům (disková difuzní metoda, E-test)
  • detekce aktivit beta-laktamas metodou MALDI-TOF MS
  • genotypizační metody (PFGE, AFLP, RAPD, ERIC, MLST, mP-BiT…)
  • příprava geneticky modifikovaných kmenů bakterií
  • metabolická aktivita buněk biofilmu s využitím MTT testu nebo resazurinu
  • semikvantifikace biofilmu barvením krystalovou violetí
  • konstrukce DNA knihoven pro 16S rRNA geny a ITS oblast
  • detekce bodových polymorfismů (SNP) metodou MALDI-TOF MS
  • kvantifikace, viabilita a rekonstrukce struktury biofilmů
  • bioluminiscenční analýza aktivit signálních molekul systému quorum sensing

Ekotoxikologické testy

  • test s luminiscenční bakterií Vibrio fischeri
  • test klíčení semen

Test mutagenity

  • Amesův test
  • kometový test
  • HPRT test

Stabilita proteinů, studium interakce proteinů

  • Tycho – měření denaturačních křivek proteinů (např. na kontrolu stability proteinů)
  • GST – pull-down
  • imuno – pull-down
  • Thermoforéza (Monolith) – studium interakcí protein-protein, protein-nukleová kyselina, protein-liposomy

Příprava liposomů s různým složením (případně fluorescenčně značených) a studium jejich interakce s proteiny

Autentizace lidských buněčných linií metodou STR

Testování antibakteriálních aktivit

Testování korozní rychlosti degradovatelných materiálů

Bioinformatika

  • Protein-ligand docking (Glide, Plants)
  • Simulace molekulové dynamiky (Gromacs, Plumed)
  • Predikce struktury proteinů (Modeller)
[urlnadstranka] => [iduzel] => 58857 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/58857 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [10947] => stdClass Object ( [nazev] => Přístup odepřen (chyba 403) [seo_title] => Přístup odepřen [seo_desc] => Chyba 403 [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => zamek [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>

Nemáte přístup k obsahu stránky.

Zkontrolujte, zda jste v síti VŠCHT Praha, nebo se přihlaste (v pravém horním rohu stránek).

[urlnadstranka] => [iduzel] => 10947 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error403] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_ikona [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [1485] => stdClass Object ( [nazev] => Stránka nenalezena [seo_title] => Stránka nenalezena (chyba 404) [seo_desc] => Chyba 404 [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Chyba 404

Požadovaná stránka se na webu (již) nenachází. Kontaktuje prosím webmastera a upozorněte jej na chybu.

Pokud jste změnili jazyk stránek, je možné, že požadovaná stránka v překladu neexistuje. Pro pokračování prosím klikněte na home.  

Děkujeme!

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 1485 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error404] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 29705 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => dokumenty [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [519] => stdClass Object ( [nadpis] => [data] => [poduzel] => stdClass Object ( [61411] => stdClass Object ( [nadpis] => [apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/?weburl=/sis [urlwildcard] => cis-path [iduzel] => 61411 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /sis [sablona] => stdClass Object ( [class] => api_html [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 519 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => web [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )

DATA


stdClass Object
(
    [nazev] => Laboratoř molekulární biologie a virologie
    [seo_title] => Laboratoř molekulární biologie a virologie
    [seo_desc] => 
    [autor] => 
    [autor_email] => 
    [obsah] => 

Domů   Publikace

1) Virologie

V oblasti virologie zabývající se studiem struktury a biologie virů a příčin jimi způsobených onemocnění, se zaměřujeme zejména na retroviry a v poslední době v rámci spolupráce i na flaviviry. V obou případech se jedná o obalené RNA viry. Cílem našeho výzkumu je objasnění vybraných kroků životního cyklu virů se zaměřením zejména na pozdní fázi virové infekce. Pochopení molekulární podstaty těchto kroků otevírá možnosti vývoje nových typů léčiv. S použitím molekulárně biologických metod studujeme strukturu virových proteinů, funkční význam jejich strukturních domén, jejich vzájemné interakce, interakce s RNA a membránami a transport virových proteinů a celých částic v infikované buňce. Dále se zabýváme strukturou a mechanismem tvorby zralých a nezralých retrovirových částic.

fig1a fig1b

2) Medicinální chemie: teranostika a multimodální terapie

Přírodní látky jsou základem klinické terapie rakoviny i dalších onemocnění. Jejich terapeutické účinky lze měnit syntetickou derivatizací s cílem odstranění vedlejších účinků, zvýšení cytotoxicity a selektivity k patologickým buňkám, změny mechanismu účinku apod. V naší skupině se zaměřujeme především na primární výzkum toxicity a mechanismu účinku nových derivátů antimitotických látek, jako je např. kolchicin a paklitaxel, inhibitorů sarko-/endoplasmatické retikulární Ca2+-ATPasy, jako je např. thapsigargin a trilobolid anebo kardioglykosidů, jako je např. digitoxin a digoxin. Většina námi zkoumaných derivátů je určena pro multimodální či kombinatoriální terapii a teranostiku nádorových onemocnění. Teranostika zahrnuje diagnostické a terapeutické vlastnosti kombinované v jedné molekule, často se tedy jedná o konjugáty přírodních látek s fluorescenčními látkami.

fig2

3) Cytokompatibilní a antimikrobiální materiály pro výzkumné i medicinální aplikace

Další problematikou řešenou naší laboratorní skupinou je studium na míru upravených polymerů a kovových materiálů pro medicinální aplikace jako náhrady měkkých a tvrdých tkání, ale i pro vědecké účely (např. kultivace a analýza tzv. „single-cell“). Cílem tohoto výzkumu je vývoj nových možností funkčního nahrazení poškozených tkání, ale i pochopení základních mechanismů interakce buněk s podložním substrátem v závislosti na jeho nano- a mikrostruktuře. Za použití metod buněčné biologie a mikrobiologie jsou zkoumány cytokompatibilita, cytotoxicita a antibakteriální vlastnosti materiálů. Metodami molekulární biologie je pak studován mechanismus buněčné adheze, interakce buněk s materiály na molekulární úrovni anebo diferenciace buněk.

fig3

4) Fotodynamická terapie a sondy pro fluorescenční zobrazovací techniky

Fotodynamická terapie je neinvazivní terapie využívající speciální molekuly, které po aktivaci světlem produkují vysoce reaktivní kyslíkové částice aplikovatelné pro eradikaci nádorů, mikroorganismů, či léčbu kožních onemocnění. Spolupracujeme na vývoji pokročilých fotoaktivních molekul a studujeme molekulární mechanismy jejich účinku a lokalizace v živých nádorových buňkách v reálném čase. Na tyto aspekty se zaměřujeme při studiu účinnosti fotoaktivních molekul zahrnujících jak anorganické materiály (např. molybdenové klastry), tak organické molekuly (např. porfyriny, ftalocyaniny, halogenované BODIPY). Kromě toho se zaměřujeme na vývoj nových fluorescenčních sond pro zobrazovací techniky, které jsou nepostradatelným nástrojem pro medicínu i molekulárně biologický výzkum. Fluorescenční sondy nám umožňují nejen zobrazit a studovat různé buněčné struktury, ale také odhalit molekulární podstatu různých onemocnění. Naším cílem je eliminovat limitace dostupných sond, jako je vysoká toxicita, nízká specifita anebo nedostatečné fotofyzikální vlastnosti. Pro evaluaci těchto sond používáme jak běžné, tak vysoce specializované fluorescenčně mikroskopické metody (SIM, PALM/STORM).

fig4

5) Biologicky aktivní látky

Rostliny jsou říší eukaryotních, převážně fotosyntetických organismů, která čítá přes 300 tisíc druhů. V průběhu evoluce si vytvořily schopnost syntézy různých sekundárních metabolitů, které sice nejsou životně důležité, ale poskytují jim selektivní výhodu a schopnost obrany v nepříznivém prostředí. A jsou to právě sekundární metabolity, disponující biologickými aktivitami, které nacházejí uplatnění v tradiční medicíně. Pomocí modulární robotické stanice testujeme velké množství vzorků – rostlinných extraktů či jejich frakcí, izolovaných sloučenin a jejich semi-syntetických derivátů aj. K testování biologických aktivit využíváme sbírku mikrobiálních kmenů a lidských buněčných linií a sadu biochemických a genetických testů. Snažíme se nalézat nové biologicky aktivní látky, objasňovat mechanismy jejich aktivit a upozorňovat na možné negativní vlivy.

Při studiu vlastností rostlinných extraktů či izolovaných sloučenin se zaměřujeme jak na zdraví prospěšné účinky, tak na případné negativní vlivy. Našim cílem je identifikace biologicky aktivních látek a charakterizace jejich benefičních účinků za současného vyloučení případných toxikologických dopadů. Zvláštní důraz je kladen na biologicky aktivní látky se schopností modulace mnohočetné lékové rezistence.

fig3

[submenuno] => [urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [newurl_domain] => 'biomikro.vscht.cz' [newurl_jazyk] => 'cs' [newurl_akce] => '/vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol' [newurl_iduzel] => 29801 [newurl_path] => 8548/29628/29629/29705/29759/29793/29801 [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS [iduzel] => 29801 [platne_od] => 19.04.2023 11:53:00 [zmeneno_cas] => 19.04.2023 11:53:50.212802 [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Michal Strejček [canonical_url] => [idvazba] => 66030 [cms_time] => 1713244736 [skupina_www] => Array ( ) [slovnik] => Array ( ) [poduzel] => stdClass Object ( [56633] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => Eva Jablonská CV [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>
Eva Jablonská

Ing. Eva Jablonská, PhD.

kontakt

VZDĚLÁNÍ


2012-2019 Doktorský studijní program: Biochemie, VŠCHT Praha
Téma disertační práce: Testování cytokompatibility kovových materiálů pro klinické aplikace
2010-2012 Magisterský studijní program: Obecná a aplikovaná biochemie, VŠCHT Praha
2007-2010 Bakalářský studijní program: Biochemie a biotechnologie, VŠCHT Praha

PRACOVNÍ ZKUŠENOSTI


09/2014-dosud Ústav biochemie a mikrobiologie, VŠCHT Praha

ZAHRANIČNÍ STÁŽ


11/2014-3/2015:    stáž ERASMUS, University of Glasgow, UK

Čtyřměsíční laboratorní projekt, Centre for Cell Engineering: In vitro testování osteoinduktivních a osteokonduktivních vlastností titanových slitin s nanotubulární povrchovou úpravou

OBLASTI VÝZKUMU


Testování in vitro: cytokompatibilita biomateriálů, cytotoxicita, endokrinní disrupce, mutagenita, sledování míry transkripce pomocí qPCR a dPCR

PUBLIKACE

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 56633 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/jablonska [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73141] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => REDOX [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

REDOX Laboratoř

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0011~~8803i3fLzEvMySwuAQA.png [obsah] =>

Hledáme nové studenty do naší laboratoře !

Jsme přátelská a otevřená laboratoř, která se zabývá tématy oxidačního stresu, antioxidantů a redox signalizace v oborech souvisejících s lidským zdravím. Bádáme v oblasti mikrobiologie, buněčné biologie, biochemie, chemické biologie a materiálových věd.

Co je naším cílem?

Zabýváme se směsicí základního a aplikovaného výzkumu, jehož cílem je pochopit mechanismus vzniku různých chorob a následně hledat nové chytré přístupy k jejich prevenci a léčbě. Spolupracujeme s odborníky na dalších pracovištích včetně fyziků, chemiků, materiálových vědců, fyziologů a lékařů.

Co tu najdete?

Budeme vás informovat o zajímavých věcech, které chystáme - o našich nejnovějších projektech, zjištěních a možná i o zákulisí. Nejde nám však jen o práci v laboratoři. Hodně se také dělíme o své znalosti. Na našich sitích najdete vzdělávací materiály, zábavná fakta a možná i nějaké tipy pro začínající vědce. Jde nám o šíření lásky k vědě široko daleko.

Proto si tuto stránku přidejte do záložek, sledujte nás na sociálních sítích a připojte se k nám na této divoké jízdě fascinujícím světem  ◳ REDOX (png) → (šířka 215px) . Pokud máte otázky nebo nás chcete jen pozdravit, napište nám.

ZABÝVÁME SE

 ◳ PDT (png) → (originál)  ◳ MICRO (png) → (originál)  ◳ ENVI (png) → (originál)
 ◳ HYDRO (png) → (originál)  ◳ LAC (png) → (originál)  ◳ IMUNO (png) → (originál)

[urlnadstranka] => [poduzel] => stdClass Object ( [73520] => stdClass Object ( [nadpis] => My [iduzel] => 73520 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => galerie [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [73205] => stdClass Object ( [akce] => Zpět [objekt] => Zpět [odkaz] => https://biomikro.vscht.cz/vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol [iduzel] => 73205 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [73142] => stdClass Object ( [nazev] => [barva_pozadi] => seda [uslideru] => false [text] =>

 ◳ REDOX Tým (png) → (originál)

 ◳ Foto (png) → (originál)

Vedoucí laboratoře

doc. Ing. Jaroslav Zelenka, Ph.D.   ◳ ORCiD_mini (png) → (originál)

Postdoc

Ing. Nikola Vrzáčková, Ph.D.  ◳ ORCiD_mini (png) → (originál)

PhD studenti

Ing. Michaela Kubáňová  ◳ ORCiD_mini (png) → (originál) 

Ing. Tomáš Přibyl   ◳ ORCiD_mini (png) → (originál)

Ing. Lukáš Bláha   ◳ ORCiD_mini (png) → (originál) 

Magisterští studenti

Bc. Denisa Pineckerová  ◳ ORCiD_mini (png) → (originál)

Bc. Roman Skala

Bc. Tereza Najmanová

Bc. Anna Krátká

Bc. Tereza Vernerová

Bc. Viktorie Svadbová

Bakalářští studenti

Kateřina Pavličíková

Jiří Zvoníček

[iduzel] => 73142 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => infobox [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [73204] => stdClass Object ( [nazev] => Najdete nás na ... [barva_pozadi] => cervena [uslideru] => false [text] =>

 ◳ Twitter (png) → (originál)

 ◳ Instagram (png) → (originál)

[iduzel] => 73204 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => infobox [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [73206] => stdClass Object ( [nazev] => Foto/radiodynamická terapie nádorových onemocnění [seo_title] => Nádorová terapie [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Oktaedrální molybdenové klastry ◳ IMG_5151 (jpg) → (šířka 450px)

Molekulární klastry na bázi oktaedrálního molybdenového jádra Mo6I8 jsou schopny generovat vysoce reaktivní singletový kyslík po osvícení viditelným světlem nebo ozáření vysoce pronikajícím rentgenovým zářením. Reaktivní formy kyslíku, reaktivní singletový kyslík, reagují s biopolymery proteiny, DNA a lipidy. Neopravitelné poškození intracelulárních částí může vyvolat různé typy buněčné smrtí. Tato vlast fotosenzitivních látek je využiváná v foto/radiodynamické terapii nádorových onemocnění.

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0005~~MzIGAA.png [obsah] =>

 ◳ Mo6 (png) → (originál)

Foto/radiosensitizéry na bázi molybdenu jsou připraveny spolupracujím pracovišti, na Ústavu anorganické chemie Akademie věd ČR doktor Kamil Lang a doktor Kaplan Kirakci

V laboratoři tkáňových kultur kultivujeme nenádorové a nádorové buněčné linie, které osvěcujeme světlem určité vlnové délky nebo rentgenovým zářením. Za využití hypoxické komory můžeme pracovat za fyziologicky relevantních hladin kyslíku a příblížit se tak více realným podmínkám našeho těla. U těchto látek můžeme stanovit vstup do buněk, intracelularní produkci ROS, lokalizaci těchto sloučenin pomocí konfokálního mikroskopu. Pro mimikování realných tumorů, využiváme přípravu 3D buněčných sféroidů, které jsou fyziologicky relevantnější jelikož přirozeně mají gradient kyslíku, metabolitů a pH. Dále se pak pokoušíme modifikovat tyto molekuly, tak aby specificky cílily na nádorové buněčné linie a snížili tak případné nežádoucí účinky.


Slibné molekuly jsou dále testovány na myších modelech in vivo ve spolupráci s doktorem Milanem Reinišem z Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR. 

Antibakteriální vlastnosti sloučenin, vrstev a částic jsou určovány pomocí modelových kmenů bakterií relevantních v klinické praxi. Bakterie jsou kultivovány ve formě biofilmu, což je přirozeně se vyskytující mnohobuněčná struktura se zvýšenou fyzikální a chemickou odolností. 

 ◳ Panel (png) → (originál)

[urlnadstranka] => biomikro.vscht.cz/vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs [iduzel] => 73206 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/PDT [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73207] => stdClass Object ( [nazev] => Mikrobiologie [seo_title] => Mikrobiologie [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Divize mikrobiologie se zaměřuje na mikrobiologická témata souvísející s metabolizmem, oxidačním stresem a výskumem nových antimikrobiálních látek. V redox laboratoři se snažím objasnit složité a málo prozkoumané mechanismy, přes které světlo, oxidační stres a další enviromentální faktory ovlyvňují na buněčné a molekulární úrovni mikroorganismy, zejména bakterie a kvasinky, se kterými u nás v laboratoři pracujeme.

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0001~~881MLspPyszPyU-vVEjLzEvMAQA.png [obsah] =>

Fotodynamická inaktivace mikroorganismů (PDI)

V naší laboratoři zkoumáme fascinující svět fotoinaktivace, procesu založeném na stejném principu jako je fotodynamická terapie, po kterém jsou bakterie inaktivovány vlyvem reaktivních forem kyslíku (ROS). ROS jsou generovány fotosenzitizérem, který je ozářený světlem o jistých vlnových délkach. Ponořujeme se do složitosti této problematiky a podílíme se tak na vývoji nových metod desinfekce a sterilace,
s potenciálním přesahem do důležitých oborů jako je zdravotnictví, bezpečnosti potravin nebo taky úprava vody.

Zabýváme se i samotným testováním nových antibakteriálních látek a fotosenzitizérů pro PDI, jako například molybdénových klastrů, již dobře prozkoumanou methylénovou modř nebo i nanoroboty. Vyhodnocujeme toxické efekty na plaktonních formách bakterií, nebo taky na více rezistentním, běžně vyskutujíciímu se biofimu. 

  ◳ Obrázek1 (png) → (originál)

                                  ◳ Návrh bez názvu-14 (png) → (originál)

Oxidační stres u mikroorganizmů

Mimo jiné, i z mikrobiologického hlediska klademe významný důraz na zkoumání vlyvu oxidačního stresu u bakterií či kvasinek.  K oxidačnímu stresu dochází v momentě, když jsou buňky vystaveny nerovnováze mezi produkcí reaktivních forem kyslíku (ROS) a jejich detoxokačními mechanizmy.  Snažíme se odhalit, jak mikroorganizmy odpovídají na oxidační stres a jak se adaptují na své prostředí. Právě výskum těchto fenoménů je nezbytný k pochopení strategií virulence a přežití u patogenních bakterií, nebo role kvsinek v biotechnologických procesech

Na odhalení těchto jevů využíváme techniky kultivace, metodu měření antioxidační kapacity, detekci produkci ROS prostřednictvím fluorescenčních prób, optickou, ale i konfokalní fluorescenční mikroskopii a mnoho dalších technik.     

 ◳ sodapdf-converted (jpg) → (originál)
 ◳ obrko (png) → (originál)

[urlnadstranka] => [iduzel] => 73207 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/73207 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73210] => stdClass Object ( [nazev] => Vliv nových materiálů na imunitní odpověď [seo_title] => Imunotoxicita [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Zabýváme se zkoumáním imunotoxicity a toxicity nových materiálů a znečišťujících látek a jejich vlivu na buňky, se zvláštním zaměřením na makrofágy a bazofily. Jsme odhodláni prohloubit naše chápání interakcí mezi těmito materiály a lidským imunitním systémem, zejména ve vztahu k tvorbě reaktivních forem kyslíku (ROS) a rozvoji alergií. Pochopení toho, jak tyto materiály ovlivňují naše buňky, je zásadní pro posouzení jejich bezpečnosti v průmyslových a lékařských odvětvích průmyslu

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0001~~88wtzcuPT0pMzgYA.png [obsah] =>

Makrofágy jsou jedním z klíčových hráčů v imunitní reakci a my zkoumáme, jak může expozice novým materiálům ovlivnit jejich funkci. Studujeme fagocytární aktivitu, produkci cytokinů a tvorbu ROS u lidských makrofágů při vystavení různým materiálům, abychom zjistili jejich vliv na mechanismy imunitní obrany.

 ◳ BF (png) → (šířka 450px)Další imunitní buňky bazofily mají zásadní význam pro alergické reakce a my zkoumáme, jak může expozice novým materiálům vyvolat alergické reakce. Náš výzkum se zaměřuje na degranulaci bazofilů a uvolňování prozánětlivých mediátorů, které hrají klíčovou roli v rozvoji alergie, která je v dnešní době častější než kdykoli předtím.

Reaktivní formy kyslíku se podílejí na různých buněčných procesech, včetně imunitních reakcí. Zkoumáme, jak mohou nové materiály indukovat produkci ROS v imunitních buňkách, a hodnotíme potenciální důsledky zvýšené hladiny ROS, jako je oxidační stres a zánět.

Věnujeme se vlivu těchto materiálů při posuzování jejich bezpečnosti. Zkoumáním vlivu nových materiálů na lidské imunitní buňky, jakož i vlivu zvýšené hladiny ROS a vzniku alergií, chceme poskytnout poznatky, které podpoří odpovědné a bezpečné používání těchto materiálů v různých průmyslových odvětvích a zároveň ochrání lidské zdraví.

 ◳ Fluoro (png) → (originál)

[urlnadstranka] => [iduzel] => 73210 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/imunotoxicita [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73345] => stdClass Object ( [nazev] => Laktát [seo_title] => Laktát [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Laktát neboli anion kyseliny mléčné je v naší laboratoři poměrně velké a dlouhodobé téma. Všichni jsme už tento pojem v souvislosti s lidským tělem pravděpodobně někdy slyšeli, nejčastěji ve spojení s fyzickým vyčerpáním. A skutečně, dlouhou dobu bylo na laktát nahlíženo pouze jako na odpadní produkt anaerobní glykolýzy při nedostatečném zásobení tkání kyslíkem, který je zodpovědný za svalovou bolest a únavu. Nicméně, nic není černobílé a nedávné výzkumy částečně tyto poznatky rozporují a zároveň ukazují, že může být i tělu prospěšný, neboť je rovněž významnou signální molekulou zapojenou do řady metabolických procesů, či nezanedbatelným zdrojem energie pro naše nervové buňky.

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0001~~80nMLkk801iiYGQEAA.png [obsah] =>

 ◳ Mléčná kyselina (png) → (šířka 215px)Jak se to tedy celé s laktátem má?  Obecně řečeno, laktát může mít v kontextu lidského těla pozitivní i negativní roli. Negativní dopady má zejména laktát produkovaný nádorovou a ischemickou tkání. Naopak u laktátu vznikajícího při fyzické námaze nebo konzumovaného jako funkční složka (postbiotikum) fermentovaných potravin jsou pozorovány pozitivní efekty, mezi které se například řadí adaptace těla na stresové podmínky skrze mitochondriální hormezi, rychlejší regenerace tkání a naopak oddálení jejich stárnutí či kontrola homeostázy tukové tkáně a snížení rizika rozvoje obezity a inzulínové rezistence.

V naší laboratoři se věnujeme hned několika projektům zaměřeným zejména na laktát a jeho zdravotní benefity. Zabýváme se například účinky laktátu na buněčné úrovni u tkáňových linií lidských fibroblastů. Tyto buňky dlouhodobě ovlivňujeme laktátem tak, abychom simulovali situaci, která v těle nastává při a po intenzivním cvičení, a snažíme se u nich odhalit případné fyziologické změny. Zaměřujeme se zejména na rozdíly v růstové rychlosti a v přechodu do senescence, zároveň se zabýváme účinky na buněčné antioxidační mechanismy a aktivitu mitochondrií či na potenciální ochranu proti karcinogenezi. Neomezujeme se však pouze na jednotlivé buňky a tkáňové linie, naše laboratoř se také podílí na výzkumu vlivu laktátu u myších modelů, kterým byl laktát přidáván do stravy. Aktuálně pracujeme na analýze jejich střevního mikrobiomu a jaterního proteomu s cílem objevit ať už pozitivní či negativní změny, které by mohly souviset s přítomností laktátu ve stravě. V ideálním případě bychom tak mohli dostat odpověď na otázku, co je podstatou benefitů konzumace kysaných potravin, či teoreticky přispět k vývoji léčiva založeného na laktátu, které by cílilo na zmírnění civilizačních onemocnění, což je a do budoucna bohužel jistě ještě více bude u lidské populace značný problém.

 ◳ LA (png) → (originál)

[urlnadstranka] => [iduzel] => 73345 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/laktat [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73744] => stdClass Object ( [nazev] => Fyziologie vodíku [seo_title] => Fyziologie vodíku [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Léčba kardiovaskulárních, neurodegenerativních a autoimunitních onemocnění, reparace poškozených tkání, protinádorová terapie, zmírnění rizik souvisejících s obezitou včetně rozvoje metabolického syndromu a diabetu druhého typu, ale také i zvýšení sportovní výkonnosti, rychlejší regenerace po náročném tréninku či vyšší výnosy v zemědělství. Všechna tato slova a slovní spojení mají jedno společné pojítko, a to sice molekulární vodík. 

[ikona] => [obrazek] => 0001~~C8tPyTzTmA0A.png [ogobrazek] => [pozadi] => 0001~~C8tPyTzTmK1gBAA.png [obsah] =>

 ◳ Hydrogen (png) → (šířka 215px)Ano, vodík! Nejmenší, nejjednodušší a ve vesmíru nejrozšířenější prvek, o kterém se ve vědecké sféře nejčastěji mluví jako o palivu budoucnosti či v souvislosti s jadernou fúzí. Naopak v biologických a biochemických oblastech mu v minulosti nebyla věnována příliš veliká pozornost a byl považován za inertní látku s minimálními účinky na živé organismy. Zlom nastal v roce 2007, kdy byly u něj objeveny specifické antioxidační účinky u tkáňových linií. Započal intenzivní výzkum i v těchto vědeckých odvětvích a byly publikovány desítky a stovky odborných článků, které molekulárnímu vodíku připisují antioxidační, antiapoptotické a protizánětlivé účinky, čehož lze využít při prevenci a léčbě mnohých onemocnění.  Rovněž bylo zjištěno, že má pozitivní vliv na činnost mitochondrií a že může být v buňkách zapojen do řady signalizačních drah. Nicméně doposud nebyl u něj popsán přesný mechanismus účinku a mnoho věcí s ním spojených stále čeká na objevení.

Studium biologických účinků molekulárního vodíku je v naší laboratoři poměrně nové téma, na kterém spolupracujeme s docentem PhDr. Michalem Botkem, Ph.D. z Fakulty tělesné výchovy Univerzity Palackého v Olomouci. Zatímco pan doc. Botek podává molekulární vodík v podobě hydrogenované vody přímo sportovcům, u kterých za daných podmínek pozoruje například zvýšení jejich výkonnosti, v naší laboratoři se zaměřujeme na studium vlivu vody obohacené o molekulární vodík na lidské tkáňové kultury, u kterých se snažíme odhalit případné změny v buněčné fyziologii a metabolismu. V současné době se zabýváme zejména vlivem na buněčnou hladinu reaktivních forem kyslíku (ROS), celkovou buněčnou antioxidační kapacitu či expresi transkripčního faktoru Nrf2, který je v buňkách do značné míry zodpovědný za navýšení aktivity jejich antioxidačních mechanismů.

[urlnadstranka] => [iduzel] => 73744 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/73744 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [73986] => stdClass Object ( [nazev] => Zněčišťující látky v životním prostředí [seo_title] => Zněčišťující látky v životním prostředí [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Chlorované parafíny

Kontaminanty představují významné riziko pro životní prostředí a lidské zdraví. Mezi relativně novou a málo prozkoumanou skupinu kontaminantů patří chlorované parafíny, které v mnohých odvětvích nahradily velmi rizikové polychlorované bifenyly. ◳ Chloro (png) → (originál)

[ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => 0001~~c87IyS_KL0vMSz3TqFCQWJSYlnmmMa8SAA.png [obsah] =>

Chlorované parafíny jsou polychlorované n-alkany vznikající radikálovou chlorací iniciovanou UV světlem. Dle délky uhlíkatého řetězce je dělíme na krátké SCCP, středně dlouhé MCCP, a dlouhé LCCP. SCCP byly využívány v průmyslu jako zpomalovače hoření, kovoobráběcí kapaliny, složky barev či tmelů. Roku 2017 však byly SCCP dle Stockholmské konvence zařazeny mezi perzistentní organické polutanty. Jejich produkce a použití jsou tedy omezeny a regulovány. Jak již tomu ale v průmyslu bývá, po zákazu SCCP se trh přeorientoval na novou skupinu látek, MCCP, jež mají velmi podobné vlastnosti, a proto předpokládáme i podobné účinky na životní prostředí. Produkce MCCP rok od roku vzrůstá, což může potenciálně vést k závažné kontaminaci životního prostředí, jejíž náprava by trvala roky až desítky let.

 ◳ Contaminants (png) → (originál)Chlorované parafíny podobně jako další organochlorované sloučeniny jsou látky nepolárního charakteru, které se snadno akumulují v tukových tkáních. Důležitou otázkou z hlediska in vitro působení CP je, zda CP dokážou prostupovat do buňky nebo ovlivňují buněčnou fyziologii jako extracelulární agens. Odpověď na tuto otázku je stále nejasná. Na druhou stranu bylo zjištěno, že SCCP způsobují nepřímou a přímou toxicitu. Kromě in vitro buněčných modelů byly chlorované parafíny studovány i s použitím různých živočišných modelů – od hadů a žab, přes slepice a další ptáky, až po laboratorní myši a potkany. U všech testovaných organismů byla zaznamenaná významná akumulace SCCP, ale rovněž MCCP.

CP byly rovněž nalezeny v biologických matricích, jako je plazma, placenta, pupečníková krev či mateřské mléko. Bylo ukázáno, že SCCP i MCCP přecházejí přes placentu do plodu a následně kojením do těla novorozenců. Data z biomonitorovacích studií zabývajících se přítomností CP v lidských tkáních jsou nadále nedostatečná, jelikož se studium CP soustředí ve většině případů pouze na oblast Číny, která je největším producentem a konzumentem CP.

Jakékoli další poznání v oblasti chlorovaných parafínů může vést k rozklíčování jejich účinků na živé organismy a potenciálně k omezení či zakázání jejich použití v průmyslu.

  ◳ PREADIPOCITY (png) → (originál)

[urlnadstranka] => [iduzel] => 73986 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs/73986 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 73141 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/redox-cs [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [56550] => stdClass Object ( [nazev] => Laboratoř molekulární biologie a virologie [seo_title] => Fotoaktivní molekuly 1 [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Domů   Publikace

Fotobiologie materiálů na bázi klastrů Mo6I8 a porfyrinových trámců

Molekulární klastry založené na motivu Mo6I8 s variabilními vnějšími ligandy a porfyrinové trámce sdílejí schopnost katalyzovat produkci vysoce reaktivního singletního kyslíku po osvětlení světlem nebo ozáření rentgenovými paprsky. Lze z nich připravit rozpustné molekuly, nanovrstvy nebo nanočástice, které mohou po osvětlení nebo ozáření zabíjet rakovinné buňky nebo patogenní bakterie. Naše skupina testuje biologické vlastnosti těchto nových materiálů ve spolupráci s Dr. Kamilem Langem a Dr. Kaplanem Kirakci z Ústavu anorganické chemie AV ČR. V našem zařízení pro práci s tkáňovými kulturami pěstujeme normální a rakovinné buňky lidského původu a osvětlujeme je speciálními světelnými zdroji nebo ozařujeme rentgenovými paprsky. Naše hypoxická komora nám umožňuje pracovat s nízkou fyziologickou hladinou kyslíku. Pomocí konfokálního mikroskopu nebo strukturní iluminační super-rezoluční mikroskopie (SIM) můžeme určit buněčnou akumulaci a lokalizaci studovaných sloučenin nebo nanočástic. Nanočástice jsou také specificky cílené na rakovinné buňky pomocí molekulárního rozpoznávání. Slibné materiály jsou dále testovány na myších modelech ve spolupráci s Dr. Milanem Reinišem z Ústavu molekulární genetiky AV ČR. Antibakteriální vlastnosti sloučenin, vrstev a nanočástic jsou stanovovány pomocí našeho mikrobiologického vybavení s použitím modelových kmenů bakterií relevantních pro klinickou praxi. Bakterie jsou kultivovány ve formě biofilmu, přirozeně se vyskytující mnohobuněčné struktury se zvýšenou fyzikální a chemickou odolností.

fig1
Princip fotosenzitizujícího působení molybdenového klastru.

fig2
Mikroskopická kolokalizace molybdenového klastru (červeně) a lysozomů (zeleně) v nádorové buňce.

fig3
Mikroskopická kolokalizace molybdenového klastru (červeně) a bakterií Enterococcus faecalis.

fig4
Antibakteriální působení materiálů je ověřováno kultivačními metodami.

Podpora

  • Biomateriály obsahující oktaedrické molybdenové klastry jako radiosensitizátory singletového kyslíku, GA18-05076S, Grantová agentura ČR

Publikace

  1. Kirakci K., Nguyen T.K.N., Grasset F., Uchikoshi T., Zelenka J., Kubát P., Ruml T., Lang K.: Electrophoretically Deposited Layers of Octahedral Molybdenum Cluster Complexes: A Promising Coating for Mitigation of Pathogenic Bacterial Biofilms under Blue Light. ACS Appl Mater Interfaces, 2020. IF 8,758
  2. Kirakci K., Demel J., Hynek J., Zelenka J., Rumlová M., Ruml T., Lang K..: Phosphinate Apical Ligands: A Route to a Water-Stable Octahedral Molybdenum Cluster Complex. Inorg Chem 58:16546–16552, 2019. IF 4,850
  3. Kirakci K., Zelenka J., Rumlová M., Cvačka J., Ruml T., Lang K.: Cationic octahedral molybdenum cluster complexes functionalized with mitochondria-targeting ligands: photodynamic anticancer and antibacterial activities. Biomater Sci 7:1386-1392, 2019. IF 5,831
  4. Kirakci K., Zelenka J., Rumlová M., Martinčík J., Nikl M., Ruml T., Lang K.: Octahedral molybdenum clusters as radiosensitizers for X-ray induced photodynamic therapy. J Mater Chem B 6:4301-4307, 2018. IF 5,047
  5. Hynek J., Zelenka J., Rathouský J., Kubát P., Ruml T., Demel J., Lang K.: Designing Porphyrinic Covalent Organic Frameworks for the Photodynamic Inactivation of Bacteria. ACS Appl Mater Interfaces 10:8527-8535, 2018. IF 8,456
  6. Buzek D., Zelenka J., Ulbrich P., Ruml T., Krizova I., Lang J., Kubat P., Demel J., Kirakci K., Lang K.: Nanoscaled porphyrinic metal-organic frameworks: photosensitizer delivery systems for photodynamic therapy. J Mater Chem B 5:1815-1821, 2017. IF 5,047
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 56550 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/fotoaktivni-molekuky [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [56632] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => Tomáš Ruml CV [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>
Girl in a jacket

prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc.

Tel: +420 220443022
Email: tomas.ruml@vscht.cz

VZDĚLÁNÍ


2008 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav kvasné chemie a bioinženýrství
Kandidát biologických věd, Obor: Mikrobiologie
Disertační práce: Studium exkrece thiaminu u mutantů Saccharomyces cerevisiae
1973–1978 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav kvasné chemie a bioinženýrství
Obhajoba Ing. Obor: kvasné chemie a technologie
Diplomová práce: Fysiologické charakteristiky Candida utilis rostoucí na ethanolu

PRACOVNÍ ZKUŠENOSTI


09/2013-08/2020 vedoucí Ústavu biochemie a mikrobiologie, VŠCHT, Praha
01/2012–12/2019 děkan FPBT VŠCHT, Praha
2009/2011 prorektor pro zahraničí - VŠCHT, Praha
2006/2009 proděkan pro vědu a výzkum FPBT VŠCHT, Praha
12/2002 – dosud profesor, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha
01/1996 – dosud docent, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha
09/1984 odborný asistent, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha

ODBORNÁ ZPŮSOBILOST


Struktura, interakce, transport a funkce retrovirových proteinů a částic, biosorpce těžkých kovů, biodegradace pesticidů, vliv organických látek na lidské buňky, biokompatibilita materiálů pro klinické aplikace, aktivita molekul a nanočástic pro fotodynamickou terapii, Bioprospekce - analýza léčivých účinků mořských a rostlinných zdrojů

ORGANIZAČNÍ ČINNOST


Hlavní organizátor 3 mezinárodních symposií: „Retrovirus Assembly Meeting“ (2000, 2004 a 2008 v Praze), spoluorganizátor 6 dalších mezinárodních symposií

ZAHRANIČNÍ STUDIJNÍ POBYTY


University of Alabama at Birmingham - virologie 1989-1991, 1994 (3 měsíce), 1996 (3 měsíce), 1998 (3 měsíce); City College New York (aktivace protoonkogenů) 1993 (3 měsíce)

PUBLIKAČNÍ AKTIVITA


Vědecké práce ve WoS: 206
Spoluautor 8 patentů (z toho dva realizovány licenční smlouvou)
Počet citací bez autocitací: 3 343
H-index: 31

PEDAGOGICKÁ AKTIVITA


Zavedl nový studijní program - Forenzní analýza, inicioval a spoluzaložil nový studijní program Bioinformatika.

Zavedl a vyučoval nové kurzy: Molekulární genetika, Genové inženýrství, Genetické manipulace - laboratorní kurz, Průmyslová mikrobiologie; Učil: Mikrobiologie. Laboratoř: Mikrobiologie, Biochemie, Mikrobiální analýza potravin.

Vedl 84 obhájených diplomových prací (4 cena J. Hlávky za nejlepší diplomovou práci) a 24 Ph.D. studenti úspěšně obhájili své práce (jedno 3. místo v ceně Sanofi Pasteur, dvěma uděleno Votočkovo stipendium a jedna Cena J. Hlávky).

OCENĚNÍ


2012 Cena ministra školství, mládeže a tělovýchovy „Za mimořádné výsledky výzkumu, experimentálního vývoje a inovací“
2014 Cena rektora „Za mimořádné výsledky ve výzkumu a úspěšnou propagaci vědy“
2015 Cena Vietnamského presidenta „Za zásluhy o porozumění mezi národy“
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 56632 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/ruml [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [56548] => stdClass Object ( [nazev] => Laboratoř molekulární biologie a virologie [seo_title] => Kovové materiály [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Domů Publikace

Kovové materiály pro použití v ortopedii

Trendy vývoje nových biomateriálů pro použití v ortopedii se zaměřují na dosažení vhodných mechanických vlastností, antibakteriálního působení a schopnost urychlení hojení. Dalším trendem je použití degradovatelných materiálů u dočasných aplikací, což eliminuje nutnost reoperace. Nové biomateriály, které jsou vyvíjeny našimi spolupracovníky, musí být nejprve testovány a schváleny. Na našem pracovišti se zabýváme prvním stupněm testování biomateriálů s použitím buněčných kultur a relevantních metod.

fig1a fig1b

Snímek lidských imortalizovaných kmenových buněk odvozených z tukové tkáně rostoucích na titanové slitině s nanoúpravou (modře jádro, červeně aktinová vlákna); Elektronmikroskopický snímek myších fibroblastů rostoucích na hořčíkové slitině (zvětšení 2000 x)

Způsob řešení a metody

Sledujeme korozní rychlost v biologických médiích za fyziologických podmínek, testujeme in vitro cytotoxicitu biomateriálů dle normy ISO 10993-5 (zkouška na extraktech s vyhodnocením metabolické aktivity pomocí resazurinu) a sledujeme kolonizaci povrchů materiálů buňkami pomocí mikroskopických technik (pomocí fluorescenční i skenovací elektronové mikroskopie). Jako buněčné modely používáme myší fibroblasty i buněčné linie odvozené od lidské kostní tkáně. Testujeme také antibakteriální vlastnosti materiálů.

Kontakt

Ing. Eva Jablonská, Ph.D.
doc. Ing. Jan Lipov, Ph.D.
prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc.

Publikace

Spolupráce

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 56548 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/molvirol/kovove-materialy [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [56535] => stdClass Object ( [nazev] => [barva_pozadi] => seda [uslideru] => false [text] =>

vedoucí skupiny:

prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc.

docenti:

doc. Ing. Jan Lipov, Ph.D.

doc. Ing. Jaroslav Zelenka, Ph.D.

odborní asistenti:

Ing. Silvie Rimpelová, Ph.D.

Ing. Jan Prchal, Ph.D.

Ing. Markéta Častorálová, PhD.

Ing. Eva Jablonská, Ph.D.
Ing. Vladimíra Pavlíčková, Ph.D.
Ing. Nikola Vrzáčková, Ph.D.

doktorandi:

Ing. Jiřina Kaufmanová

Ing. Habibullah Giyaullah

MSc. Lan Hoang

Ing. Radim Novotný

Ing. Barbora Vokatá

Ing. Jakub Sýs

Ing. Jan Škubník

Ing. Jiří Bejček

Ing. Bára Křížkovská
Ing. Michaela Kubáňová
Ing. Lukáš Bláha
Ing. Tomáš Přibyl
Ing. Karolína Burešová


technický personál:

Radka Budilová

[poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 56535 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => infobox [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )


VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

zobrazit plnou verzi