Celá rostlina je jeviště a signální molekuly jsou v ní herci
stdClass Object
(
[nazev] => Ústav biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha
[adresa_url] =>
[api_hash] =>
[seo_desc] =>
[jazyk] => cs
[jednojazycny] =>
[barva] =>
[indexace] => 1
[obrazek] =>
[ga_force] =>
[cookie_force] =>
[secureredirect] =>
[google_verification] => UOa3DCAUaJJ2C3MuUhI9eR1T9ZNzenZfHPQN4wupOE8
[ga_account] => UA-10822215-6
[ga_domain] =>
[ga4_account] => G-VKDBFLKL51
[gtm_id] =>
[gt_code] =>
[kontrola_pred] =>
[omezeni] =>
[pozadi1] => 883MLsrPT8rMz8lPz0wFAA.jpg
[pozadi2] =>
[pozadi3] =>
[pozadi4] =>
[pozadi5] =>
[robots] =>
[htmlheaders] =>
[newurl_domain] => 'biomikro.vscht.cz'
[newurl_jazyk] => 'cs'
[newurl_akce] => '[cs]'
[newurl_iduzel] =>
[newurl_path] => 8548/29628/29629
[newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
[iduzel] => 29629
[platne_od] => 31.10.2023 17:01:00
[zmeneno_cas] => 31.10.2023 17:01:37.080471
[zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
[canonical_url] =>
[idvazba] => 37730
[cms_time] => 1713867862
[skupina_www] => Array
(
)
[slovnik] => stdClass Object
(
[logo_href] => /
[logo] => 
[logo_mobile_href] => /
[logo_mobile] =>
[google_search] => 001523547858480163194:u-cbn29rzve
[intranet_odkaz] => https://intranet.vscht.cz/
[intranet_text] => Intranet
[mobile_over_nadpis_menu] => Menu
[mobile_over_nadpis_search] => Hledání
[mobile_over_nadpis_jazyky] => Jazyky
[mobile_over_nadpis_login] => Přihlášení
[menu_home] => Domovská stránka
[paticka_mapa_odkaz] =>
[paticka_budova_a_nadpis] => BUDOVA A
[paticka_budova_a_popis] => Rektorát, oddělení komunikace, pedagogické oddělení, děkanát FCHT, centrum informačních služeb
[paticka_budova_b_nadpis] => BUDOVA B
[paticka_budova_b_popis] => Věda a výzkum, děkanát FTOP, děkanát FPBT, děkanát FCHI, výpočetní centrum, zahraniční oddělení, kvestor
[paticka_budova_c_nadpis] => BUDOVA C
[paticka_budova_c_popis] => Dětský koutek Zkumavka, praktický lékař, katedra ekonomiky a managementu, ústav matematiky
[paticka_budova_1_nadpis] => NÁRODNÍ TECHNICKÁ KNIHOVNA
[paticka_budova_1_popis] =>
[paticka_budova_2_nadpis] => STUDENTSKÁ KAVÁRNA CARBON
[paticka_budova_2_popis] =>
[paticka_adresa] => VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373
Datová schránka: sp4j9ch
Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum
[paticka_odkaz_mail] => mailto:Tereza.Kobzova@vscht.cz
[zobraz_desktop_verzi] => zobrazit plnou verzi
[aktualizovano] => Aktualizováno
[autor] => Autor
[drobecky] => Nacházíte se: VŠCHT Praha – FPBT – Ústav biochemie a mikrobiologie
[den_kratky_3] => st
[novinky_kategorie_1] => Akce VŠCHT Praha
[novinky_kategorie_2] => Důležité termíny
[novinky_kategorie_3] => Studentské akce
[novinky_kategorie_4] => Zábava
[novinky_kategorie_5] => Věda
[novinky_archiv_url] => /novinky
[novinky_servis_archiv_rok] => Archiv z roku
[novinky_servis_nadpis] => Nastavení novinek
[novinky_dalsi] => zobrazit další novinky
[novinky_archiv] => Archiv novinek
[den_kratky_5] => pá
[preloader] => Prosím počkejte chvíli...
[den_kratky_1] => po
[archiv_novinek] =>
[nepodporovany_prohlizec] =>
[zobraz_mobilni_verzi] =>
[social_yt_odkaz] =>
[social_fb_odkaz] => https://www.facebook.com/mikrobio320
[social_tw_odkaz] =>
[social_fb_title] => facebook stránka ústavu
[social_tw_title] =>
[den_kratky_4] =>
[social_in_odkaz] =>
[den_kratky_2] =>
[novinka_publikovano] => Publikovano:
[novinka_datum_konani] => Datum konani:
[novinky_servis_kategorie_vse] => vše
[novinky_servis_archiv_submit] => Filtrovat
[hledani_nadpis] => hledání
[hledani_nenalezeno] => Nenalezeno...
[hledani_vyhledat_google] => vyhledat pomocí Google
[den_kratky_0] =>
[social_li_odkaz] =>
[more_info] =>
[dokumenty_kod] =>
[dokumenty_nazev] =>
[dokumenty_platne_od] =>
[dokumenty_platne_do] =>
[den_kratky_6] =>
)
[poduzel] => stdClass Object
(
[29704] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[poduzel] => stdClass Object
(
[29708] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 29708
[canonical_url] => //biomikro.vscht.cz
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[29709] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 29709
[canonical_url] => //biomikro.vscht.cz
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[29710] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 29710
[canonical_url] => //biomikro.vscht.cz
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
)
[iduzel] => 29704
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[29705] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[poduzel] => stdClass Object
(
[72638] => stdClass Object
(
[nazev] => Akce Běstvina
[seo_title] => Akce Běstvina
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] => Výjezdní studentská konference Běstvina
O co jde?
Studentské konference na Běstvině (dříve na mlejně) se aktivně a více-méně povinně v rámci předmětů „Prezentace odborného projektu“ účastní studenti 1. ročníku magisterských studijních oborů Biochemie a buněčná biologie, Mikrobiologie a genové inženýrství a Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví. Na této konferenci mají studenti možnost vyzkoušet si prezentaci výsledků svých vědeckých projektů v rámci diplomové práce před širším publikem. Toto publikum je však nanejvýš shovívavé, neboť je z velké většiny tvořeno spolužáky. V obecenstvu je též zpravidla přítomno i několik zkušenějších kolegů z řad doktorandů, doktorů, docentů či dokonce profesorů.
Kde se konference koná?
Výjezdní studentská konference se koná v táborové základně blízko malé vesničky Běstvina (49.8325517N, 15.5812344E), kterou VŠCHT získala v roce 2019. Ta se nachází v podhůří Železných hor, asi 30 km jižně od Pardubic (více informací zde). Oproti mlýnu, ve kterém se studentská konference konala dříve, oplývá základna především velkou ubytovací kapacitou, ale je zde též několik sportovišť (fotbalové, basketbalové či volejbalové hřiště a další; vybavení bude k dispozici na místě), několik ohnišť, klubovna a rozlehlá společenská místnost. Zajímavostí je, že se právě zde pravidelně odehrává Letní odborné soustředění mladých chemiků a biologů čili odborné soustředění nejúspěšnějších řešitelů krajských kol chemické a biologické olympiády.
Výhodou tohoto umístění je bezesporu krásné prostředí, ale též izolace od okolního světa, která velkou měrou přispívá ke sblížení spolužáků. K tomu může dojít při hraní deskových her či při společném dovádění na hudební nástroje (kdo umí, ať si doveze), anebo při sportovním vyžití. Nevýhodou by se mohla zdát relativní vzdálenost základny od restauračních zařízení, které sbližování též napomáhají, ale i v tomto směru nabízí pořadatelé akce jisté možnosti… (půllitr s sebou!)
Organizace
Příjezd a odjezd
Konference začíná v následujícím pondělí po magisterkých státnicích, což většinou vychází na druhý až třetí týden v červenci. Odjezd autobusu od budovy B VŠCHT je naplánován na 8:30. Dle zájmu je možné objednat k autobusu přívěs na kola. Účastnící preferující dopravu po vlastní ose nechť kontaktují organizátory (základna je vybavena parkovištěm pro větší počet vozů).
Na první den je naplánována exkurze do jednoho z biotechnologických objektů po cestě nebo okolí. Na táborovou základnu tak dorazíme v odpoledních hodinách. Večeři první den tradičně zajistí starší kolegové a kolegyně.
Podle množštví účstníků akce trvá do soboty nebo neděle. Odjezd probíhá po vlastní ose. Nejbližší vlaková stanice se nachází v obci Třemošnice, odkud je to na základnu zhruba 6 km. V případě vysokokapacitních zavazadel a hromadného dojezdu je možné povolat motorizovanou jednotku, která s převozem zavazadel pomůže. Z Běstviny se ale také můžete dostat přímým autobusem do Pardubic. Vášniví cyklisté též mohou vyrazit na kole po vlastní ose, například do Čáslavi nebo do Pardubic.
Možnosti předčasného odjezdu jsou omezené a záleží na zařazení do přednáškové sekce. Plánování přednáškových sekcí probíhá přímo před začátkem konference dle účasti starčích kolegyň a kolegů, kteří působí jako chairs jednotlivých sekcí.
Konference
Hlavním programem jsou prezentace studentských vědeckých projektů, které se již za rok promítnou do diplomových prací. Přednášky zpravidla nejsou časově omezeny, ale obvyklý rozsah je cca 20 min. Podle počasí je jeden den v týdnu vyhrazen pro celodenní výlet, většinou se organizovaně jde na blízkou sečskou přehradu, kde je možné i koupání, anebo po vlastní ose.
Absolutně nutné je přivézt si sebou nejlépe již hotovou prezentaci ve standardních formátech (ppt, pptx, pdf...). Na základně je samozřejmě zaveden elektrický proud (i v chatičkách) a dokonce je vybavena i funkční wifi, ale trávení večerů v chatičkách doděláváním prezentace vás může ochudit o spoustu zajímavých zážitků.
Spaní
Studenti budou zřejmě organizováni do chatiček, nejčastěji po dvou osobách, které budou vybaveny čistě povlečenou matrací. V táboře je monost získání dek s povlečením, nicméně je lepší si pro jistotu přibalit spacák či jiné spací propriety. Doporučujeme též dovézt si i teplejší oblečení, protože červnové noci (a někdy i dny) bývají ještě studené.
Jídlo
Jedním z nezapomenutelných zážitků spojených s konferencí ve mlejně bylo vaření. Na mlejně si totiž účastníci vařili sami a vařit pro zhruba 60 strávníků bylo v na jednom sporáku nebylo nic snadného. Na Běstvině je tradice společného vaření zachována, avšak místní kuchyně je dimenzována pro více než 150 strávníků. Kuchyně je kvalitně vybavena konvektomatem, restaurační myčkou na nádobí, řadou varen a sporáků a různými dalšími vymoženostmi. O první společnou nedělní večeři, ale též pondělní snídani se postará starší osazenstvo, proto se v případě náročnějších strávníků stačí vybavit větší svačinou. O další jídlo pro všechny se již starají sami studenti, kteří si na každý den volí službu. V kuchyni není problém si kdykoliv udělat čaj nebo kávu. Nákupy se řeší operativně, nejbližší větší obchod je v Třemošnici (Penny market). Na společné jídlo se všichni skládají, takže je nutné se vybavit přiměřeným kapesným. Dle zkušeností z minulých let se celkový příspěvek na jídlo se vejde do 500 Kč. Speciální strava (vegetariáni, lepek, sportovci) v minulých letech nikdy nebyla problém.
Ostatní vybavení
Vřele doporučujeme si dále přibalit repelent (klíšťat je všude dost), hudební nástroj (pokud na nějaký hrajete), deskové a jiné hry a půllitr. Na této konferenci je totiž již tradicí mít k dispozici čepované pivo. Ostatní pitný režim si zajišťuje každý sám.
Volný den
V nabitém přednáškovém týdnu je též nutné najít čas na regeneraci namáhaných mozkových buněk. Proto je do týdenního programu zařazen též volný den, který je věnován aktivnímu odpočinku.
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 72638
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /bestvina
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => stranka_galerie
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[73334] => stdClass Object
(
[nazev] => Intranet ÚBM
[seo_title] => Intranet ÚBM
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] =>
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 73334
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /intranet
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => boxy
[html] =>
[css] =>
[js] => $(function() {
setInterval(function () { $('*[data-countdown]').each(function() { CountDownIt('#'+$(this).attr("id")); }); },1000);
setInterval(function () { $('.homebox_slider:not(.stop)').each(function () { slide($(this),true); }); },5000);
});
function CountDownIt(selector) {
var el=$(selector);foo = new Date;
var unixtime = el.attr('data-countdown')*1-parseInt(foo.getTime() / 1000); if(unixtime<0) unixtime=0;
var dnu = 1*parseInt(unixtime / (3600*24)); unixtime=unixtime-(dnu*(3600*24));
var hodin = 1*parseInt(unixtime / (3600)); unixtime=unixtime-(hodin*(3600));
var minut = 1*parseInt(unixtime / (60)); unixtime=unixtime-(minut*(60));
if(unixtime<10) {unixtime='0'+unixtime;}
if(dnu<10) {unixtime='0'+dnu;}
if(hodin<10) {unixtime='0'+hodin;}
if(minut<10) {unixtime='0'+minut;}
el.html(dnu+':'+hodin+':'+minut+':'+unixtime);
}
function slide(el,vlevo) {
if(el.length<1) return false; var leva=el.find('.content').position().left; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1;
var cislo=leva/sirka*-1; if(vlevo) { if(cislo+1>pocet) cislo=0; else cislo++; } else { if(cislo==0) cislo=pocet-1; else cislo--; }
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
function slideTo(el,cislo) {
if(el.length<1) return false; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; if(cislo<0 || cislo>pocet) return false;
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
[autonomni] => 1
)
)
[73018] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 73018
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /akce
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => stranka
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[67241] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 67241
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /SVK
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => stranka
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[67203] => stdClass Object
(
[nazev] =>
[seo_title] => Pseudocronobacter
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] => Main spectrum projections of "pseudo-Cronobacter" strains from the article B. Svobodová, J. Vlach, P. Junková, L. Karamonová, M. Blažková & L. Fukal: Novel Method for Reliable Identification of Siccibacter and Franconibacter Strains: from “Pseudo-Cronobacter” to New Enterobacteriaceae Genera. Applied and Environmental Microbiology 83(13) e00234-17. DOI: 10.1128/AEM.00234-17.
EB29_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB31_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB32_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB33_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB35_Franconibacter_helveticus_MspExport.btmsp
EB38_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB39_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB41_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB42_Franconibacter_pulveris_MspExport.btmsp
EB44_Siccibacter_turicensis_MspExport.btmsp
EB45_Siccibacter_turicensis_MspExport.btmsp
Also available at Zenodo
Seznam mikroorganismů sbírky ÚBM naleznete na adrese https://web.vscht.cz/~savickad/ (dostupné z domény vscht.cz).
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 66832
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /[cs]/66832
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => stranka
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[65263] => stdClass Object
(
[nazev] =>
[ikona] =>
[autor] =>
[kod] =>
[platne_od] =>
[platne_do] =>
[keywords] =>
[popis] => Aktuální problematika mikrobiologie potravin 2022
[iduzel] => 65263
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /[cs]/konference
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => dokument
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[62131] => stdClass Object
(
[nazev] => SVK 2021 - Výherci
[seo_title] => SVK2021
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] =>
|
Sekce |
1. místo |
2. místo |
3. místo |
Cena sponzora |
|
Produkce a studium proteinů |
Bc. Blanka Husťáková |
|||
|
Biomedicínské aplikace |
Bc. Jana Psotová |
Bc. Kateřina Bašusová |
||
|
Bioanalytické metody a jejich aplikace |
Bc. David Straka |
|||
|
Interakce v biologických systémech |
Bc. Veronika Tomšovská |
|||
|
Vliv malých molekul na metabolismus |
Bc. Irena Jochovičová |
Bc. Mária Goliašová |
||
|
Mikrobiologie |
||||
|
Genetika |
Bc. Jan Šnábl |
Všem umístěním gratulujeme! Sborník všech příspěvků si můžete stáhnout zde.
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 62131 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/62131 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [42959] => stdClass Object ( [nazev] => Akce Mlejn [seo_title] => Akce Mlejn [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Výjezdní studentská konference MLEJN
O co jde?
Studentské konference na mlejně se aktivně zúčastní studenti 1. ročníku magisterských studijních oborů Mikrobiologie, Obecná a aplikovaná biochemie a Laboratorní metody a příprava léčivých přípravků. Na této konferenci mají studenti možnost vyzkoušet si prezentaci výsledků svých vědeckých projektů v rámci diplomové práce před širším publikem. Toto publikum je však nanejvýš shovívavé, neboť je z velké většiny tvořeno spolužáky. V obecenstvu je též zpravidla přítomno i několik zkušenějších kolegů z řad doktorandů, doktorů, docentů či dokonce profesorů.
Konferenci předchází společná exkurze významného biotechnologického pracoviště.
Kde se konference koná?
Výjezdní studentská konference se koná (jak již název napovídá) ve mlýně, a to doslova. Tento vysloužilý mlýn, který svou kapacitou vyhoví právě skupince mikrobiologů, biochemiků a klinických biochemiků, se nachází uprostřed lesa poblíž vesničky Myslív blízko Nepomuku (https://en.mapy.cz/s/2oqcr). Výhodou tohoto umístění je bezesporu krásné prostředí, ale též izolace od okolního světa, která velkou měrou přispívá ke sblížení spolužáků. K tomu může dojít při hraní deskových her či při společném dovádění na hudební nástroje (kdo umí, ať si doveze) ve vnitřních prostorách mlýna, anebo při sportovním vyžití na rozlehlé zahradě a v blízkém okolí. Nevýhodou by se mohla zdát vzdálenost mlýna od restauračních zařízení, které sbližování též napomáhají, ale i v tomto směru nabízí i samotný mlýn jisté možnosti… (půlitr s sebou!)
Organizace
Exkurze
Akce Mlejn začíná dne 11.6. exkurzí do Plzeňského pivovaru. Sraz bude v 7:30 před VŠCHT odkud bude odjíždět přistaveným autobusem v 8:00. Součástí exkurze je dobrovolná degustace piva v ceně 100 Kč na osobu.
Konference
Po exkurzi (někdy kolem poledne) následuje přesun na místo pobytu, jímž je mlýn u obce Myslív blízko Nepomuku (souřadnice 49⁰ 25' 50.262“ N 13⁰ 35' 15.167“ E, 49.430628, 13.587546, https://en.mapy.cz/s/2oqcr). V následujících dnech budou hlavním programem prezentace vašich vědeckých projektů. Přednášky zpravidla nejsou časově omezeny, ale obvyklý rozsah je cca 15 min. Podle počasí je jeden den v týdnu vyhrazen pro celodenní výlet, buď na kole, nebo pěšky. Akce končí v neděli 17.6. individuálním přesunem domů. Možnosti předčasného odjezdu jsou omezené a záleží na zařazení do přednáškové sekce. Plánování přednáškových sekcí probíhá přímo před začátkem konference.
Standardní harmonogram:
|
8:00 - 9:00 |
snídaně |
|
9:00 - 10:30 |
dopolední sekce I |
|
10:30 -11:00 |
coffee break |
|
11:00 - 12:30 |
dopolední sekce II |
|
13:00 |
oběd |
|
16:00 - 17:30 |
odpolední sekce I |
|
17:30 - 18:00 |
coffee break |
|
18:00 - 19:30 |
odpolední sekce II |
|
20:00 |
večeře |
Doprava
Pokud se chystáte jet vlastním autem, neměl by to být problém, prosíme ale, abyste sdělili tuto skutečnost předem (na spiwokv@vscht.cz). Kolo je velmi vítané na celodenní výlet, každodenní vyjížďky po okolí, případně i cestu domů. Autobus, který nás poveze na exkurzi, bude vybaven přívěsem na kola (prosíme o sdělení počtu cyklistů a cyklistek na spiwokv@vscht.cz).
Povinné vybavení a další informace
Spaní
Přestože mlejn oplývá kapacitou pro ubytování kolem šedesáti lidí, nenabízí spaní na posteli či matraci zdaleka pro každého. Je proto nutné vybavit se kompletem pro spaní na podlaze (karimatka, spacák). Doporučujeme též dovézt si i teplejší oblečení, protože červnové noci (a někdy i dny) bývají ještě studené.
Prezentace
Absolutně nutné je přivézt si sebou nejlépe již hotovou prezentaci ve standardních formátech (ppt, pptx, pdf..). V mlejně je samozřejmě zaveden elektrický proud a dokonce je vybaven i funkční wifi, ale trávení večerů na pokoji doděláváním prezentace vás může ochudit o spoustu zajímavých zážitků.
Jidlo
Jedním z nezapomenutelných zážitků spojených s konferencí ve mlejně je místní vaření. Na mlejně si totiž účastníci vaří sami. No a vařit pro zhruba 60 strávníků není v místních podmínkách nic snadného. Přesto nás (myšleno starší účastníky) každý rok překvapí, jaké kulinářské zážitky jsou schopni studenti zajistit. O první společnou večeři v pondělí i oběd v úterý se většinou postará starší osazenstvo, proto se stačí vybavit větší svačinou pro případ, kdyby se nestíhal pondělní oběd v Plzni po exkurzi. V dalších dnech se o vaření starají již sami studenti, kteří si na každý den volí službu. Nákupy se řeší operativně, nejbližší obchod je v Myslívě, avšak nejčastěji je jezdí s hromadným seznamem do Nepomuku. Na společné jídlo se tedy všichni skládáme, takže je nutné se vybavit přiměřeným kapesným. Dle zkušeností z minulých let však chceme upozornit, že celkový příspěvek na jídlo se vejde do 400 Kč. Vždy ale záleží na nárokách a invencích daného ročníku.
Ostatní vybavení
Vřele doporučujeme si dále přibalit repelent (klíšťat je všude dost), hudební nástroj (pokud na nějaký hrajete), deskové a jiné hry a půllitr. Na mlejně je totiž již tradicí mít k dispozici čepované pivo. Ostatní pitný režim si zajišťuje každý sám.
Volný den
V nabitém přednáškovém týdnu je též nutné najít čas na regeneraci namáhaných mozkových buněk. Proto je do týdenního programu zařazen též volný den, který je věnován aktivnímu odpočinku. Zde jen pár možností, co se dá podnikat v okolí mlejna:
Cyklovýlet
Pod vedením cyklistického guru Vojty Spiwoka je možné zúčastnit se celodenního výletu směr Horažďovice, Rábí a zpět, který je vhodný pro horská, krosová a s malou objížďkou i silniční kola (https://en.mapy.cz/s/2oqhV).
Angusfarma
Velmi oblíbenou variantou je též pěší výlet za nevšedním gurmánským zážitkem na Angusfarmu do blízkých Soběsuk (https://www.angusfarm.cz/).
Techmania Science Centre v Plzni
Zajímavou variantou je výlet do vědecko-technického centra v Plzni (http://techmania.cz/cs/).
Koupání v lomu
Nedaleko mlýna se nachází zatopený lom s průzračně čistou vodou. Pokud je počasí nakloněno, je koupačka v lomu velmi příjemnou záležitostí.
Proč to všechno?
Motivací, proč pořádáme výjezdní studentskou konferenci ve mlejně, je hned několik. Přínosem je pro studenta nejen možnost vyzkoušet si prezentovat své výsledky před širším publikem, ale především povinnost se po roce bádání zastavit a sesumírovat si všechny dosavadní výsledky i již plánované další postupy. V rámci diskuze po prezentaci se pak sám dozví, zda je schopen získané výstupy či navržené postupy obhájit, popřípadě jak postupovat, aby to se mu to povedlo lépe. Velmi cenný je též nezávislý pohled ostatních zkušenějších kolegů přítomných v obecenstvu, kteří velmi rádi poskytují své zkušenosti v oboru. Prosíme studenty, aby nechápali diskuzi po prezentaci jako nutné zlo, ale spíše jako možnost konstruktivně probrat řešení různých zádrhelů, se kterými se během vypracovávání své diplomové práce setkává každý student.
Co se týče osobního úhlu pohledu, je mlejnská sešlost výbornou šancí, jak se lépe seznámit se spolužáky i se zkušenějšími pracovníky z ústavu. Dobré kontakty získané během studia na vysoké škole mohou být totiž velmi výhodné i během další kariéry. Studentská konference ve mlejně je navíc již léty prověřená akce a její efekt na sbližování lidí byl experimentálně prověřen jako velmi pozitivní.
Laboratoř je akreditována podle ČSN EN ISO/IEC 17025:2018 Českým institutem pro akreditaci o.p.s. jako zkušební laboratoř č. 1316.3
Činnost ZL ÚBM je rozdělena do dvou laboratoří:
- Laboratoře mikrobiologie
- Laboratoře geneticky modifikovaných organismů (GMO)
Laboratoř mikrobiologie:
Mikrobiologické analýzy potravin
- Stanovení celkového počtu mikroorganismů v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU*
- Horizontální metoda průkazu a stanovení Listeria monocytogenes v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Stanovení počtu kvasinek a plísní v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Horizontální metoda průkazu bakterií rodu Salmonella v potravinách, pokrmech,krmivech a PBU
- Stanovení počtu koagulázopozitivních stafylokoků v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Stanovení počtu Listeria monocytogenes v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Horizontální metody pro průkaz a stanovení bakterií čeledi Enterobacteriacae potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Stanovení počtu β-glukuronidázopozitivních Escherichia coli v potravinách, pokrmech, krmivech a PBU
- Stanovení počtu presumptivního Bacillus cereus v potravinách, potravinářských surovinách a krmivech
- Stanovení počtu bakterií r.Lactobacillus v potravinách a pomrmech, potravinových doplňcích
* PBU předměty běžného užívání
Mikrobiologické analýzy pitné vody, balené vody v plném rozsahu platné legislativy
- Stanovení indikátorů fekálního znečištění (fekální streptokoky, Escherichia coli a koliformní bakterie)
- Stanovení kultivovatelných mikroorganismů při 22 °C a 36 °C
- Stanovení Clostridium perfringens
Mikrobiologické analýzy balených vod, bazénové vody
- Stanovení kultivovatelných mikroorganismů při 36 °C
- Stanovení počtu koagulázopozitivních stafylokoků
- Stanovení počtu Escherichia coli
- Stanovení počtu Pseudomonas aeruginosa
Stanovení mikrobiální kontaminace
v prostředí potravinářských provozoven a komunálních budov
Mikrobiologická analýza ovzduší
- Stanovení celkové koncentrace směsné populace plísní
- Stanovení celkové koncentrace směsné populace plísní
Kosmetika, kosmetické a zdravotnické přípravky
- Průkaz mikroorganismů sledovaných v kosmetických produktech a zdravotnických přípravcích
- Zkouška účinnosti konzervace zátěžovým testem
Identifikace mikroorganismů metodou hmotnostní spektometrie MALDI-TOF
Laboratoř geneticky modifikovaných organismů (GMO):
- Důkaz a kvantifikace GMO metodou PCR v potravinářských surovinách, potravinách a krmivech
- Kvantifikace GMO metodou real-time PCR v potravinářských surovinách, potravinách a krmivech
Pracoviště GMO je zařazeno do seznamu laboratoří s oprávněním vykonávat činnost kontroly přítomnosti a kvantifikace transgenů v povoleném rozsahu pro Ministerstvo životního prostředí.
Kontakt:
- vedoucí ZL ÚBM: prof. Ing. Kateřina Demnerová, CSc., email: Katerina.Demnerova@vscht.cz, tel. +420 220 443 025
- zástupce vedoucí ZL ÚBM: Ing. Hana Sýkorová, Ph.D., email: Hana.Sykorova@vscht.cz, tel. +420 220 443 075
Mikrobiologická laboratoř: Ing. Jana Kadavá, tel. +420 220 445 200
Laboratoř GMO: Ing. Kamila Zdeňková, PhD., tel. +420 220 445 196
Kontakty na akreditovanou Metrologickou a zkušební laboratoř VŠCHT pro chemické analýzy naleznete ZDE.
Osvědčení:
Recenze:
ZL ÚBM se vedle akreditovaných laboratorních analýz významně podílí na spolupráci se subjekty (zákazníky) v oblasti vzdělávání. Je pořadatelem řady odborných kurzů v oblasti mikrobiologie, které jsou vždy organizovány v souladu s potřebami zákazníků. Kurzy probíhají vždy ve 2 částech – teoretická a praktická v posluchačských laboratořích.
Členové týmu laboratoře se jako experti velmi aktivně podílí i na vzdělávání mikrobiologických pracovníků potravinářských laboratoří ze/v zahraničí – např. Saudská Arábie, přednášky a a laboratorní kurzy. Tyto kurzy jsou zaměřeny na detekci patogenů v potravinách. Současně se podle požadavků zákazníka věnují i zavádění nových metod a jejich validaci (pravidelné kursy pro evropské a africké mikrobiology a manažery firmy Coca Cola)
Dále populární formou organizujeme i výukové kurzy pro studenty středních škol v rámci rozšíření jejich znalostí v oblasti přírodních věd, zejména v oblasti mikrobiologie potravin.
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 42630 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /akreditovana-lab [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [39517] => stdClass Object ( [nazev] => Geneticky modifikované organismy [seo_title] => Geneticky modifikované organismy [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Nakládání s geneticky modifikovanými organismy:
Informace pro zaměstnance Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha a studenty
Havarijní plán Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha pro práci s GMO (zkrácená verze)
Odborný poradce: prof. Ing. Kateřina Demnerová, CSc.
Osoby odpovědné za likvidaci havárie v jednotlivých laboratořích:
- Ing. Jitka Viktorová, Ph.D. - lab. V04, V03, 232c, tel: 22044-3021(5199), email: Jitka.Prokesova@vscht.cz
- doc. Ing. Petra Lovecká, Ph.D. - lab. V05, tel: 22044-5139, email: Petra.Lovecka@vscht.cz
- doc. Ing. Ondřej Uhlík, Ph.D. - lab. 209, tel: 22044-5136, email: Ondrej.Uhlik@vscht.cz
- doc. Ing. Petra Lipovová, Ph.D. - lab. 234, tel: 22044-3028, email: Petra.Lipovova@vscht.cz
- doc. Dr. Ing. Zuzana Novotná - lab. 207, tel: 22044-4341, email: Zuzana.Novotna@vscht.cz
- prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc. - lab. V06, 237, 239, BY04, BY05, tel: 22044-3021, email: Tomas.Ruml@vscht.cz
- prof. Ing. Pavel Kotrba, Ph.D. - lab. 129b, tel: 22044-3215, email: Pavel.Kotrba@vscht.cz
- RNDr. Jarmila Zídková, CSc. - lab. 211, 233a, tel: 22044-5154(5155), email: Jarmila.Zidkova@vscht.cz
- Ing. Kamila Zdeňková, Ph.D. - lab. BY06, BY07, BY09, BY12, tel: 22044-5196(5201), email: Kamila.Zdenkova@vscht.cz
Plán pracoviště: Plánek bude všem dodán, hlavní je vědět, kde je hlavní uzávěr vody, elektřiny a plynu pro každou laboratoř!!!
Plán s označením hlavních ovladačů přívodu energií a bezpečnostními prvky je nedílnou součástí tohoto Havarijního plánu a je zahrnut jako Příloha 5; 5a a 5b.
V případě požáru bude vypnut hlavní přívod elektřiny a plynu (vyznačeno na plánku rozmístění laboratoří) a dle rozsahu požáru bude zvolen způsob hašení (pěnové hasící přístroje, voda). Pracovníci jsou povinni řídit se interním požárním řádem VŠCHT Praha. Při likvidaci požáru bude zohledněna práce s GMO a dle potřeby a situace bude pracoviště následně ošetřeno desinfekčním prostředkem (chlornan sodný 0,5-1%, Ajatin 0,5-2%).
V případě poškození vodovodního řadu a vytopení laboratoře bude nejdříve uzavřen hlavní přívod vody (viz plánek Příloha 5; 5a a 5b), kultury GMO budou přeneseny do jiného uzavřeného prostoru a prostor bude přiměřeně asanován a vysušen. Při současném úniku GMO do prostředí budou použity desinfekční prostředky a po ukončení asanace bude sledována přítomnost transgenů nebo jejich produktů metodami uvedenými v bodě j) tohoto Havarijního plánu.
Při úniku GMO zařazených do těchto kategorií, v uzavřeném prostoru i mimo něj nehrozí bezprostřední ohrožení zdraví lidí ani ohrožení životního prostředí a GMO je možno likvidovat postupem v laboratoři běžným (autoklávování 121 °C, 0,15 MPa, 50 min, použití desinfekčních prostředků). Za havárie ve vlastním slova smyslu se NEPOVAŽUJÍ malé úniky GMO (několik mililitrů), při nichž uniklé GMO mohou být rychle a spolehlivě zlikvidovány použitím desinfekčních prostředků. Za havárii je nutno považovat rozšíření GMO mimo laboratoře (chodby), určené k uzavřenému nakládání s GMO.
Při přenosu nádob s transgenním materiálem např. z kultivační místnosti do laboratoře může dojít k rozlití většího objemu této kultury (např. 1 litr). Zasažená místa je nutné s použitím ochranných rukavic vysušit, odpad zlikvidovat autoklávováním a místo ošetřit v dostatečném rozsahu dvěma typy desinfekčních roztoků: např. Ajatinem (0,5-2%) a následně chlornanem sodným (0,5-1%).Všichni musí vědět, kde v laboratoři je ajatin a Chlornan sodný (SAVO).
Potřeby pro kultivaci rostlin je třeba mýt v roztoku chlornanu v plastové vaně. Po 24 hod. stání je možno roztok zlikvidovat vylitím do komunálního odpadu.
Při rozšíření semen (desítky kusů) nebo vegetativních částí, schopných samostatného rozmnožování, je třeba především zabránit možnosti odnesení částí rostlin na obuvi apod. Dále je nutné asepticky odklidit pevné části do plastového pytle a sterilovat autoklávováním a zasažené místo pak ošetřit desinfekčním prostředkem tak, jak je uvedeno výše.
V případech havárie odlišné od zde popsaných je nutno postupovat podle pokynů odborného poradce.
V případě havárie bude informován odborný poradce, vedoucí ÚBM a děkan fakulty.
Přenos kultur
Při přenosu kultur GMO z kultivačních místností do laboratoří bude situace řešena v závislosti na objemu kultury. Malé objemy budou přenášeny v plastikových uzavřených obalech, velké objemy v přepravkách překrytých alobalem. Podobně při přenášení kultur a materiálu z laboratoří k likvidacím autoklávováním do k tomu určené místnosti B250 budou malé objemy, kultury na plotnách nebo použité plasty přenášeny v plastikových uzavřených obalech s piktogramem Biohazard, větší objemy v uzavřených lahvích a baňkách jištěných v přepravce a překrytých folií. Přenášený a převážený rostlinný materiál bude neprodyšně uzavřen v plastových nebo plechových nádobách (obalech) a označen značkou Biohazard nejméně 5 cm velkou na protilehlých stranách. Pokud bude materiál přepravován vozem, automobil bude označen nápisem Biohazard a v autě bude k disposici popis přepravovaného materiálu a obecné instrukce, jak postupovat s uzavřeným kontejnerem obsahujícím transgenní materiál (neotvírat, dopravit na ÚBM VŠCHT Praha). Vědečtí pracovníci mají k dispozici genové mapy a sekvence insertů, s nimiž pracují a v případě úniku lze těchto znalostí využít pro monitorování případného úniku transgenu a následnou likvidaci a asanaci.
Likvidace
V případě úniku geneticky modifikovaných mikroorganismů a rostlin bude vymezen zasažený prostor, výrazně označen a ohraničen (křídou, fixem, výstražné nápisy) a bude zamezen přístup osob. Prostor bude ošetřen 0,5-1% chlornanem sodným a následně 0,5-2% Ajatinem. Po chemické asanaci se kontaminovaná plocha ozáří germicidní lampou výkon 2x25W. Jednotlivé drobné předměty, které byly únikem zasaženy, budou autoklávovány. Transgenní rostliny, které by unikly mimo vymezené bariéry, budou smeteny a autoklávovány v pytlích. Nepřítomnost geneticky modifikovaných mikroorganismů bude dokumentována odebráním vzorků z původně zasaženého místa a průkazem nepřítomnosti GMO nebo jejich produktů. (Smotkem gázy navlhčeným sterilní vodou bude setřeno cca 50x50 cm plochy, gáza eluována malým množstvím vody a bude použita buď jako templát pro PCR s použitím primérů odvozených od sekvence insertu nebo k imunochemické detekci produktů transgenů.) Toto je i postup pro přípravu pro sledování GMO, když se vede deník.
Popis a nákres uložení asanačních prostředků použitelných ke zneškodnění
Koncentrovaný a naředěný roztok (0,5-1%) chlornanu sodného a koncentrovaný a naředěný roztok (0,5-2%) Ajatinu budou umístěny v označených skříních umístěných ve všech místnostech určených pro uzavřené nakládání s GMO.
V případě havárie budou ihned vyrozuměni telefonicky event. emailem vedoucí pracoviště, osoby zodpovědné za likvidaci havárie jmenovitě uvedené v bodě d) tohoto Havarijního plánu a odborný poradce a bude zajištěna okamžitá dekontaminace.
Provozní plán Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha pro práci s GMO
Kategorie rizika nakládání s geneticky modifikovaným organismem, které smí být na pracovišti prováděno: Kategorie rizika I a II.
Seznam pracovníků proškolených pro práci s GMO na pracovišti
V Provozním řádu, který vám bude dodán, jsou doplněni pracovníci ÚBM a PGS studenti. Každá laboratoř přidá k Provoznímu řádu seznam studentů (magistři a bakaláři) aktuálně pracujících v laboratoři.
Povinnosti pracovníků při práci
Stávající pracovníci a PGS studenti uvedení v seznamu pro jednotlivé laboratoře byli proškoleni na provádění všech metod uvedených v odstavci g) Provozního řádu. Za dodržování pracovních postupů v jednotlivých laboratořích jsou zodpovědní příslušní vedoucí laboratoří. Školení budou pravidelně opakována.
Po ukončení práce v laboratoři mají pracovníci povinnost zajistit bezpečné uložení biologického materiálu s transgenní DNA, otřít pracovní plochu chemickou desinfekcí (např. 0,5-1% roztokem chlornanu sodného). Použitý materiál s GMO určený k likvidaci bude sterilován v autoklávu 50 minut při 121 °C, přetlak 0,15 MPa. Postup dekontaminace nástrojů při ukončení pracovní činnosti se řídí podle charakteru činnosti a určuje jej vedoucí laboratoře. Ochranné oděvy kontaminované geneticky modifikovanými mikroorganismy se budou prát jako infekční materiál: samostatný sběr a oddělená izolovaná přeprava.
Systém a četnost kontrol prostoru, zařízení a ochranných opatření
Kontroly čistoty pracovních ploch budou prováděny pověřenými proškolenými pracovníky s četností 1krát za 6 měsíců s platností od října 2016 (do září 2016 3krát ročně): stěry - sledování výskytu používaných mikroorganismů a pomocí PCR metody bude detekován příslušný transgen. U autoklávů určených pro likvidaci GMO (místnost B250 a BY12) budou pravidelně kontrolovány předepsané parametry pro bezpečnou sterilizaci externími servisními techniky a zaprotokolovány v provozní knize přístroje. Lednice a mrazáky určené pro uchovávání GMO jsou bezpečně uzamčeny a klíče jsou k dispozici u vedoucího příslušné laboratoře. Možnost výskytu přenašečů GMO (hmyz, hlodavci) je vyloučena zajištěním laboratoří, jejichž dveře a okna jsou trvale uzamčené nebo opatřené koulí. Laboratoře jsou klimatizované, okna jsou proti vniknutí hmyzu zajištěna síťkami. Zápis v Knize kontrol o každé kontrole bude parafován vedoucím příslušné laboratoře, odborným poradcem a vedoucím příslušné katedry.
Zásady vedení pracovních protokolů
Každá činnost s GMO je zaznamenávána do pracovních protokolů každého pracovníka s vyznačením čísel stránek, data zápisu a poznámkou o způsobu likvidace nepotřebných GMO.
Opatření k zabránění vstupu nepovolaných osob
Laboratorní prostory jsou rozděleny na funkční jednotky. Do každé jednotky je možný vstup pouze jedněmi dveřmi otevíratelnými klíčem. Klíče mají pracovníci, kteří v jednotce pracují. Studenti VŠCHT Praha mají do nich přístup pouze ve speciálních pláštích označených značkou Biohazard, které jsou nošeny pouze v těchto prostorách.
Přílohy:
- 2020 VŠCHT Potvrzení o přijetí Oznámení
- 2020 VŠCHT Oznámení
- 2017 VŠCHT Potvrzení o přijetí Oznámení
- 2017 VŠCHT Oznámení - Hodnocení rizika
- Potvrzení o přijetí oznámení o nakládání s GMO
- Oznámení o uzavřeném nakládání I. a II kategoria rizika
- Příloha 1 - Hodnocení rizika spojeného s uzavřeným nakládáním s GMM, BL a GMVR
- Příloha 2 - Provozní řád ÚBM pro práci s GMO pro práci v uzavřeném prostoru
- Příloha 3 - Havarijní plán ÚBM pro práci s GMO
- Příloha 4-I - Srovnávací tabulky požadavků dle vyhlášky č. 209/2004 Sb. a přijatých opatření - I. kategorie rizika
- Příloha 4-II - Srovnávací tabulky požadavků dle vyhlášky č. 209/2004 Sb. a přijatých opatření - II. kategorie rizika
- Příloha 5
- Školení GMO 2020
- Školení GMO 2020 - MŽP
Posláním Ústavu biochemie a mikrobiologie je pedagogická a výzkumná činnost v oblastech biochemie, mikrobiologie, biologie a molekulární genetiky. Ústav zajišťuje výuku základních kurzů těchto disciplín v bakalářském studiu pro celou Fakultu potravinářské a biochemické technologie. Řada specializovaných předmětů je vyučována v navazujícím studiu magisterském a doktorském. Do výzkumných projektů cílevědomě zapojujeme posluchače všech stupňů studia v rámci řešení úkolů bakalářských, diplomových a disertačních prací.
Ústav biochemie a mikrobiologie zajišťuje v bakalářském studiu výuku předmětů (biochemie, mikrobiologie, biologie a další) pro obory studijních programů FPBT, včetně nového oboru Forenzní analýza. Biochemie je přednášena pro studenty všech fakult VŠCHT. V magisterském studiu zajišťuje ústav výuku dvou oborů, patřících do programu Biochemie a biotechnologie, a to Mikrobiologie a Obecné a aplikované biochemie. Dále zajišťujeme výuku programu Klinická bioanalytika oboru Laboratorní metody a příprava léčivých přípravků.
V rámci těchto bakalářských a magisterských programů, buď vlastními silami, nebo ve spolupráci s dalšími pracovišti VŠCHT nebo dalšími institucemi, vyučujeme předměty z oblastí biochemie, mikrobiologie, metod biochemického výzkumu a bioanalytiky, medicínských předmětů, molekulární biologie a genového inženýrství, forenzní analýzy a biologie. Dále vyučujeme vybrané předměty v angličtině.
Ústav je akreditován pro výchovu doktorandů postgraduálního studia v oborech Biochemie a Mikrobiologie. Zájemci a zájemkyně o doktorské studium mohou kontaktovat jednotlivé laboratoře nebo sekretariát ústavu.
[urlnadstranka] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 29758 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /studium [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [29759] => stdClass Object ( [nazev] => Vědecké zaměření ústavu [seo_title] => Vědecké zaměření ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Ústav biochemie a mikrobiologie rozvíjí základní výzkum v oblastech molekulární biologie retrovirů, proteomiky, biochemie, fyziologie a molekulární biologie rostlin, enzymologie, mikrobiologie životního prostředí, potravinářské mikrobiologie a bioanalytických metod. Tyto aktivity vytváří platformu pro aplikovaný výzkum cílený na vývoj moderních terapeutických přístupů, možnosti bioremediací organických a anorganických zátěží v životním prostředí a sledování hygienické kvality potravin (ústav provozuje i akreditovanou Zkušební laboratoř ústavu biochemie a mikrobiologie) či interakcí rostlin s patogeny. Výzkum je v řadě případů interdisciplinárního charakteru a vedle úzké odborné spolupráce mezi jednotlivými laboratořemi ústavu by byl nemyslitelný bez kooperace s řadou národních a zahraničních pracovišť v rámci společných výzkumných programů a projektů. Na národní úrovni se pracoviště ústavu podílí na řešení úkolů Centra aplikované genomiky a na řešení výzkumného záměru Progresivní potravinářské a biochemické technologie. Současně jsou na ústavu řešeny úkoly projektů podporovaných GA ČR, TA ČR, MPO, MŠMT.
Vědecko-výzkumné portfolio ústavu v bodech:
Oblast medicínsky orientovaného výzkumu a vývoje
- biologie skládání retrovirových částic a struktura a buněčný transport retrovirových proteinů se zřetelem na využití modifikovaných částic pro genové terapie
- identifikace proteinů místně deponovaných v souvislosti s aplikací implantátů nebo kalcifikací stěn srdečních chlopní a cév; biokompatibilní materiály pro kožní náhrady
- konstrukce nanočástic cílených do nádorových buněk k zobrazení karcinomů, testování cytostatik, rostlinné nukleasy jako protinádorová terapeutika a lipidová tělíska jako nosiče cílených hydrofobních léčiv
- účinky adipokinů a možnosti nutriční a farmakologické intervence při metabolickém syndromu
- rostlinné a hmyzí peptidy s antimikrobiálním účinkem jako terapeutika
- glykosidasy extrémofilů pro enzymové syntézy terapeuticky významných derivátů sacharidů
- vývoj a aplikace nových metod molekulárního modelování a strukturní bioinformatiky
Oblast kontroly a bioremediací životního prostředí
- metabolické konverze xenobiotik a využití mikroorganismů a rostlin pro bioremediace znečištění prostředí organickými xenobiotiky
- genomika a metagenomika pro studium mikrobiální diverzity a genetického potenciálu se zřetelem na symbiosu mikrobiálních konsorcií a rostlin a jejich synergii v bioremediačních procesech
- molekulární determinanty fosfolipidového signálního systému rostlin v odpovědi na biotický a abiotický stres se zvláštním zřetelem na využití mechanismů indukované rezistence v alternativní ochraně rostlin proti chorobám
- vývoj imunochromatografických souprav pro stanovení xenobiotik a posuzování xenobiotik, jejich metabolických intermediátů a těžkých kovů z hlediska cytotoxicity, genotoxicity a fyziologického dopadu jejich ingesce
- biochemické a molekulárně biologické aspekty (hyper)akumulace těžkých kovů velkými houbami se zvláštním zřetelem na determinanty využitelné pro fytoremediace
- transgenní rostliny pro fytoremediace půd a sedimentů kontaminovaných organickými xenobiotiky a těžkými kovy
- povrchová expozice vazebných peptidů pro zvýšení kapacity mikrobiálních biosorbentů těžkých kovů
- perspektivy lipidových tělísek pro likvidace ropných havárií a snažší syntézy degradovatelných plastů
Oblast kontroly a bezpečnosti potravin
- vývoj moderních rychlých metod záchytu a kvantifikace potravinových patogenů (detekce a kvantifikace pomocí PCR, a DNA čipů, genotypizační metody, imunochemické metody včetně vývoje imunochromatografických souprav) doplněné klasickými mikrobiologickými metodami.
- molekulární biologie enterotoxinů Staphylococcus aureus
- tvorba biofilmů a sledování jejich resistence vůči disinfekčním prostředkům
- resistence vybraných potravinových patogenů k antibiotikům
- akreditované metody a vývoj nových metod detekce a kvantifikace geneticky modifikovaných potravinových surovin a potravin
- identifikace peptidů vážících ionty těžkých kovů v potravinových surovinách a potravinách
Oblast interakce rostlin s patogeny
- studium rostlinné imunity
- modelová rostlina Arabidopsis thaliana
- interakce zemědělsky významné plodiny řepky olejky s patogenem Leptosphaeria maculans
- PCR, měření fytohormonů, měření typických odpovědí rostlin na napadení patogeny (ROS, calosa …), symptomy (Hyaloperenospora arabidopsidis, Pseudomonas syringae, Botrytis cinerea)
Kromě pedagogické a vědecko-výzkumné činnosti nabízí Ústav biochemie a mikrobiologie analýzy, kurzy, semináře a poradenství pro zájemce z jiných akademických organizací nebo firem.
V připadě zájmu kontaktujte Ing. Magdalenu Melčovou
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 29883 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /kurzy [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [58857] => stdClass Object ( [nazev] => Metody a technické vybavení ústavu [seo_title] => Metody a technické vybavení ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => atom [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>Elektoroforetické metody
- SDS-PAGE
- agarosová elektroforéza
- Western blot
- RFLP
- kapilární elektroforéza
Centrifugace, ultracentrifugace
- mikrotitrační destičky až 0,5l láhve, max. RCF 1 000 000
Chromatografické metody
- FPLC
- HPLC
- plynová chromatografie
Dezintegrace buněk
- enzymová
- mechanická - OneShot
Izolace nukleových kyselin
- DNA
- RNA
- mRNA
- cDNA
- plasmidové DNA
PCR
- PCR
- qPCR
- dPCR
Stanovení aktivity enzymů
- peroxidasa, lipasa, amylasa, cellulasa, chitinasa, galaktosidasa, glukosidsa, mannosidasa, glukuronidasa, preoteasa, trypsin, fukosidas, nukleasa, katalasa, glutathionperoxidasa, glutathionreduktasa, glutathion-S-transferasa, thioredoxinreduktasa
- další enzymy dle dohody
Produkce rekombinantních proteinů
- E. coli
- S. cerevisiae
- tkáňové kultury
- Arabidopsis thaliana
- BY2 buňky
- vyšší houby
Izolace lipidových tělísek a jejich charakterizace
- mikroskopie
- DLS
TLC analýza
- sacharidy
- lipidy
Purifikace oligosacharidů
Hmotnostní spektrometrie
- MALDI-TOF/TOF
- LC-ESI-Q-TOF
Imunochemické metody
- ELISA
- imunochromatografické testy
Spektrofotometrie: měření v kyvetách i mikrotitračních destičkách
- absorbance
- fluorescence shora/zdola
- luminiscence
- time-resolved luminiscence
- flurescenční polarizace
- u vybraných technik použití injektorů
Biolistická transformace
- rostlinných buněk
- živočišných buněk
- v intaktních organismech
Mikroskopické metody
- Fluorescenční mikroskopie a další typy světelných mikroskopií. Mnoho různých fluoroforů, objektivů i kamer. Konfokální mikroskopie (spinning disc), superrezoluční mikroskopie. Možnost pozorování živých buněk.
- Transmisní elektronová mikroskopie (TEM) - příprava vzorků pro elektronovou mikroskopii – CPD (critical point drying), pokovování, pouhlíkování, příprava ultratenkých řezů, negativní barvení
Mikrobiologické metody
- kultivační a identifikační metody klasické potravinářské mikrobiologie včetně ISO metod
- identifikace mikroorganismů metodou MALDI-TOF MS
- detekce a identifikace potravinářsky významných mikroorganismů pomocí PCR
- kultivační stanovení fenotypové rezistence k antibiotikům (disková difuzní metoda, E-test)
- detekce aktivit beta-laktamas metodou MALDI-TOF MS
- genotypizační metody (PFGE, AFLP, RAPD, ERIC, MLST, mP-BiT…)
- příprava geneticky modifikovaných kmenů bakterií
- metabolická aktivita buněk biofilmu s využitím MTT testu nebo resazurinu
- semikvantifikace biofilmu barvením krystalovou violetí
- konstrukce DNA knihoven pro 16S rRNA geny a ITS oblast
- detekce bodových polymorfismů (SNP) metodou MALDI-TOF MS
- kvantifikace, viabilita a rekonstrukce struktury biofilmů
- bioluminiscenční analýza aktivit signálních molekul systému quorum sensing
Ekotoxikologické testy
- test s luminiscenční bakterií Vibrio fischeri
- test klíčení semen
Test mutagenity
- Amesův test
- kometový test
- HPRT test
Stabilita proteinů, studium interakce proteinů
- Tycho – měření denaturačních křivek proteinů (např. na kontrolu stability proteinů)
- GST – pull-down
- imuno – pull-down
- Thermoforéza (Monolith) – studium interakcí protein-protein, protein-nukleová kyselina, protein-liposomy
Příprava liposomů s různým složením (případně fluorescenčně značených) a studium jejich interakce s proteiny
Autentizace lidských buněčných linií metodou STR
Testování antibakteriálních aktivit
Testování korozní rychlosti degradovatelných materiálů
Bioinformatika
- Protein-ligand docking (Glide, Plants)
- Simulace molekulové dynamiky (Gromacs, Plumed)
- Predikce struktury proteinů (Modeller)
Nemáte přístup k obsahu stránky.
Zkontrolujte, zda jste v síti VŠCHT Praha, nebo se přihlaste (v pravém horním rohu stránek).
[urlnadstranka] => [iduzel] => 10947 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error403] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_ikona [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [1485] => stdClass Object ( [nazev] => Stránka nenalezena [seo_title] => Stránka nenalezena (chyba 404) [seo_desc] => Chyba 404 [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Chyba 404
Požadovaná stránka se na webu (již) nenachází. Kontaktuje prosím webmastera a upozorněte jej na chybu.
Pokud jste změnili jazyk stránek, je možné, že požadovaná stránka v překladu neexistuje. Pro pokračování prosím klikněte na home.
Děkujeme!
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 1485 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error404] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 29705 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => dokumenty [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [519] => stdClass Object ( [nadpis] => [data] => [poduzel] => stdClass Object ( [61411] => stdClass Object ( [nadpis] => [apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/?weburl=/sis [urlwildcard] => cis-path [iduzel] => 61411 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /sis [sablona] => stdClass Object ( [class] => api_html [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 519 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => web [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )DATA
stdClass Object
(
[nazev] => Laboratoř biochemie rostlin
[seo_title] => Laboratoř biochemie rostlin
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] => Domů Projekty Publikace
Rostliny jsou vystaveny mnoha nepříznivým vlivům prostředí, které rozdělujeme na abiotické (teplota, sucho, osmotický stres, zasolení) a biotické (napadení různými mikroorganismy). Rostliny se umí mnoha těmto vnějším vlivům přizpůsobit a disponují řadou různých mechanismů, jakými na dané stresové podmínky reagují.
Naše laboratoř se zabývá širokým spektrem problematik spojených právě s reakcí rostlin na různé stresové faktory, přičemž se soustředíme především na roli různých proteinů v rámci stresových reakcí. Zajímají nás odpovědi odehrávající se jak na úrovni celé rostliny, tak na úrovni buňky.
Naším experimentálním materiálem je modelová rostlina huseníček rolní (Arabidopsis thaliana), ale také hospodářsky významná plodina řepka olejná (Brassica napus). Pro řešení našich projektů využíváme moderní biochemické, mikroskopické a molekulárně biologické postupy.
Spolupráce
Laboratoř má velmi úzkou spolupráci s těmito pracovišti
- Ústav experimentální botaniky AV ČR v.v.i: Laboratoř patofyziologie rostlin (vedená doc. Ing. Lenkou Burketovou, CSc.)
- Laboratoř přenosu signálů (vedená RNDr. Janem Martincem, CSc.)
- Laboratoř hormonálních regulací u rostlin (vedená RNDr. Janem Petráškem, Ph.D.)
- Katedra experimentální biologie rostlin, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
- Dr. Eric Ruelland CNRS, Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement de Paris, UMR 7618, Créteil, FRANCE; Université Paris-Est; UPEC, Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement de Paris, Créteil, FRANCE
Celá rostlina je jeviště a signální molekuly jsou v ní herci
vedoucí skupiny
prof. RNDr. Olga Valentová, CSc.
docenti
doc. Ing. Lenka Burketová, CSc.
odborní asistenti
PharmDr. Jindřiška Angelini, Ph.D.
doktorandi
[poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 55899 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => infobox [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) [55898] => stdClass Object ( [nazev] => Laboratoř biochemie rostlin [seo_title] => Laboratoř biochemie rostlin [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Domů Projekty Publikace
Rostlinná imunita
V přírodě jsou rostliny neustále konfrontovány s nepřeberným množstvím mikroorganismů, z nichž některé mohou být prospěšné jiné nikoliv (patogeni). Rostliny si v průběhu evoluce vytvořily velmi důmyslný imunitní systém, jímž na napadení patogeny reagují. V naší laboratoři se zabýváme různými aspekty studia imunity rostlin a to jak na molekulární úrovni, tak sledováním projevů celé rostliny při napadení patogeny V rámci rostlinné imunity hraje významnou úlohu fytohormon kyselina salicylová (SA), která je středobodem našich výzkumů spojených s imunitou. Kromě zapojení v imunitních reakcích rostlin se SA účastní mnoha fyziologických procesů jako je klíčení semen, buněčný růst, zavírání průduchů, senescence či výnos plodů. V současné době řešíme projekt, studující jakým způsobem je regulována biosyntéza SA enzymem fosfatidylinositol-4-kinasou a sledujeme také vliv dynamiky aktinového cytoskeletu na signální dráhu SA.
Pochopení molekulárních mechanismů souvisejících s SA je důležité i z hlediska praktického a může v budoucnu pomoci úspěšnému pěstování plodin za stresových podmínek.
Kromě zapojení SA v rostlinné imunitě se zabýváme zapojením SPFH proteinů, mezi které patří proteiny z rodin flotillinů a HIR proteiny. Flotiliny se velmi pravděpodobně účastní endocytosy nezávislé na klathrinu a jsou součástí lipidových mikrodomén. Tyto vlastnosti by jim mohly předurčovat významnou roli v rostlinné signalizaci při napadení patogeny.
Tento výzkum byl podpořen Grantovou agenturou České republiky:
- GA14-09685S - Flotillin: nový hráč stresové signalizace u rostlin
- GA17-05151S - Enzymy metabolizující fosfolipidy jako nové komponenty signální dráhy kyseliny salicylové
Reakce rostlin na abiotické stresové faktory
Zasolení půd je v současné době problém mnoha pěstitelských oblastí. Sůl jako abiotický stresor negativně ovlivňuje růst rostlin a tím i jejich produktivitu. Rostliny se solnému stresu brání a reagují na něj mnoha způsoby. Jedním z enzymů účastnících se obranných mechanismů je fosfolipasa D (PLD).
V rámci studia funkce jednotlivých isoforem fosfolipasy D v odpovědi rostlin na solný stres se zabýváme zejména fosfolipasou Dα a fosfolipasou Dδ. Jako rostlinný materiál používáme divoký typ Arabidopsis thaliana a dále mutantní linie A. thaliana s umlčenými geny kódujícími jednotlivé isoformy PLD (KO mutantní linie pld). Sledujeme změny kořenového systému a hodnotíme fenotypové projevy u divokého typu i KO mutantních linií pld po působení solného stresu.
V naší práci se také soustřeďujeme i na popis vnitrobuněčných molekulárních mechanismů účastnících se těchto změn.
LIVE imaging a jeho využití při studiu obranných reakcí na úrovni buňky - aneb mikrosvět rostlin v obraně
Jakákoliv odpověď rostliny na stresový podnět začíná vždy na molekulární úrovni – změnami ve funkci a složení proteinů a enzymů. Tyto molekuly potom postupně ovlivňují systémy vyšší – organely buněk, pletiva, orgány a nakonec se změny (v optimálním případě) projeví na úrovni celé rostliny jako adaptace na stres. Live imaging umožňuje sledovat změny proteinových komplexů a buněčných organel v reálném čase, během reakce na stresové podněty.
Studovanými proteiny jsou membránové fosfolipasy, flotilliny a další členové této rodiny - HIR proteiny. Naším cílem je objasnit jejich vzájemnou interakci a jejich interakci s cytoskeletem v rámci odpovědí buněk na environmentální stresy. Studujeme jak biotické stresory a v současné době velkou pozornost směřujeme i k nanočásticím a jejich vlivu na buňku a buněčné organely, ale i reakce orgánů rostlin.
Ke studiu těchto dějů používáme fluorescenční, konfokální a superrezoluční mikroskopii a součástí výzkumu je tedy i příprava geneticky modifikovaných – fluorescenčním proteinem značených rostlin a buněk. U takto připravených rostlin a buněk můžeme in vivo sledovat dynamiku proteinů a organel a jejich interakce po stresových podnětech.
Maximální projekce ze 13 snímků ukazuje ukládání obranného polysacharidu kalosy do vodivých drah kořene semenáčku A. thaliana ošetřeného stříbrnými ionty.
Druhý snímek představuje jednu optickou rovinu s uložením kalosy v endodermis kořene po ošetření stříbrnými nanočásticemi. Oba snímky zobrazují kombinaci fluorescenčního - modrého signálu kalosy a struktury buněk vizualizované pomocí diferenciálního interferenčního kontrastu. Měřítko = 10 μm.
Tento výzkum byl podpořen Grantovou agenturou České republiky:
- GA14-09685S - Flotillin: nový hráč stresové signalizace u rostlin
- GA17-10907S - Dopad nanočástic ušlechtilých kovů na životní prostředí
Domů Projekty Publikace
Identification of salicylic acid-independent responses in an Arabidopsis phosphatidylinositol 4-kinase beta double mutant. Annals of Botany 2020, 125(5), 775-784.
Characterisation of Arabidopsis flotillins in response to stresses . Biologia Plantarum 2019, 63, 144-152.
Interplay between phosphoinositides and actin cytoskeleton in the regulation of immunity related responses in Arabidopsis thaliana seedlings . Environmental and Experimental Botany 2019, 167, 103867.
Cell wall contributes to the stability of plasma membrane nanodomain organization of Arabidopsis thaliana FLOTILLIN2 and HYPERSENSITIVE INDUCED REACTION1 proteins . Plant J 2019, 20(24), 6365.
"Salicylic Acid Mutant Collection" as a Tool to Explore the Role of Salicylic Acid in Regulation of Plant Growth under a Changing Environment . Int J Mol Sci 2019, 101(3), 619-636.
Actin depolymerization is able to increase plant resistance against pathogens via activation of salicylic acid signalling pathway. Sci Rep 2019, 9(1),1-10.
Mapping of Plasma Membrane Proteins Interacting With Arabidopsis thaliana Flotillin 2. Front Plant Sci 2018, 9, 991.
Krčková Z., Kocourková D., Daněk M., Brouzdová J., Pejchar P., Janda M., Pokotylo I., Ott P., Valentová O., Martinec J.: The Arabidopsis thaliana non-specific phospholipase C2 is involved in the response to Pseudomonas syringae attack. Ann Bot 2018, 121 (2), 297-310.
Krutinová H, Trdá L, Kalachová T, Lamparová L, Pospíchalová R, Dobrev P, Malinská K, Burketová L, Valentová O, Janda M: Can Actin Depolymerization Actually Result In Increased Plant Resistance To Pathogens?. bioRxiv 2018, 278986.
Angelini J,Vosolsobě S, Skůpa P, Yeuan Yen Ho A. Bellinvia E, Valentová O, Marc J: Phospholipase Dδ assists to cortical microtubule recovery after salt stress. Protoplasma 2018, 255(4), 1195-1204.
Bio-based resistance inducers for sustainable plant protection against pathogens. Biotechnol Adv 2015, 33(6/2), 994-1004.
: Constitutive salicylic acid accumulation in pi4kIIIbeta1beta2 Arabidopsis plants stunts rosette but not root growth. New Phytol 2014, 203(3), 805-816.
: Changes in actin dynamics are involved in salicylic acid signaling pathway. Plant Sci 2014, 223, 36-44.
: Cell Wall Components of Leptosphaeria maculans Enhance Resistance of Brassica napus. J Agric Food Chem 2013, 61(22), 5207–5214.
Janda M, Planchais S, Djafi N, Martinec J, Burketova L, Valentova O, Zachowski A, Ruelland E: Phosphoglycerolipids are master players in plant hormone signal transduction. Plant Cell Rep 2013, 32(6), 839-851.
: Loss of membrane fluidity and endocytosis inhibition are involved in rapid aluminum-induced root growth cessation in Arabidopsis thaliana. Plant Physiol Biochem 2012, 60(), 88-97.
: beta-Aminobutyric acid protects Brassica napus plants from infection by Leptosphaeria maculans. Resistance induction or a direct antifungal effect? Eur J Plant Pathol 2012, 133(1), 279-289.
: Role of hydrogen peroxide and antioxidant enzymes in the interaction between a hemibiotrophic fungal pathogen, Leptosphaeria maculans, and oilseed rape. Environ Exp Bot 2011, 72(2), 149-156.
: The phosphatidylcholine-hydrolysing phospholipase C NPC4 plays a role in response of Arabidopsis roots to salt stress. J Exp Bot 2011, 62(11), 3753-3763.
Mutual regulation of plant phospholipase D and the acetin cytoskeleton. Plant J 2010, 62, 494-507.
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 55897 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vyzkum/vedecke-skupiny/rostliny/55897 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [38541] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [38542] => stdClass Object ( [nadpis] => [popis] => [platne_od] => [platne_do] => [odkaz] => [text_odkazu] => [obrazek_pozadi] => 0001~~8_AMMvQNMTYwSCnIBAA.jpg [barva_textu] => [iduzel] => 38542 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 38541 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )