Základem specializace je vzdělání v oblasti syntetické organické chemie nezbytné pro práci ve výzkumu a vývoji syntéz účinných látek. Pilíře tvoří organická syntéza, retrosyntéza a stereoselektivní syntézy. Profilující předměty (farmakologie, farmakochemie, lékové formy, metody analýzy léčiv a návrh léčiv) doplňují znalosti studentů v oblastech specifických pro farmaceutické výroby. Pestrá škála volitelných předmětů (např. bioorganická chemie, biologicky aktivní přírodní látky, bioléčiva, biomateriály, polymery pro farmacii, farmaceutická mikrobiologie a farmakoekonomika léčiv) doplňuje a rozšiřuje vzdělání v hraničních a souvisejících oborech.