Prosím počkejte chvíli...
Nepřihlášený uživatel
Nacházíte se: VŠCHT PrahaFPBTÚstav biochemie a mikrobiologie  → Vědecké zaměření ústavu → Vědecké skupiny → Laboratoř aplikované proteomiky
iduzel: 29795
idvazba: 66548
šablona: stranka
čas: 15.6.2024 18:07:50
verze: 5420
uzivatel:
remoteAPIs:
branch: trunk
Server: 147.33.89.153
Obnovit | RAW
iduzel: 29795
idvazba: 66548
---Nová url--- (newurl_...)
domena: 'biomikro.vscht.cz'
jazyk: 'cs'
url: '/vyzkum/vedecke-skupiny/proteomika'
iduzel: 29795
path: 8548/29628/29629/29705/29759/29793/29795
CMS: Odkaz na newurlCMS
branch: trunk
Obnovit | RAW

Laboratoř aplikované proteomiky

Domů   Projekty   Přístrojové vybavení   Tým & Publikace

Naše laboratorní skupina se věnuje proteomice, kterou lze definovat jako disciplínu zabývající se komplexním studiem proteinů. Často, i když ne vždy, jak můžete zjistit na dalších řádcích, je předmětem zájmu proteomiky proteom, což je soubor proteinů vyskytující se například v dané buněčné organele, buňce, tkáni či celém organismu v daném čase za definovaných podmínek.

Pravděpodobně jako první na světě jsme již v roce 2004 začali analyzovat pevné a nerozpustné vzorky, aniž bychom z nich proteiny předem izolovali. Specifické enzymové štěpení tak probíhá přímo ve vzorku – „in-sample digestion“ a analyzovány jsou až peptidové fragmenty uvolněné do roztoku. Tato technika umožnila aplikaci proteomiky v nejrůznějších oblastech (analýze uměleckých děl a historických objektů, kostí v dentální chirurgii a mnoha dalších).

Ke studiu proteinů používáme hmotnostně spektrometrické techniky: MALDI-TOF, LC-ESI-Q-TOF a nejnověji LC-timsTOF.

  

Příklady řešené problematiky

  • Identifikace proteinových biomarkerů závažných onemocnění v lidských biotekutinách
  • Určení živočišných i rostlinných druhů s využitím v potravinářství (např. druhové rozlišení jedlého hmyzu)
  • Proteomická analýza buněčných linií odvozených od osteoblastů a jejich diferenciace
  • Kultivace savčích buněčných linií v bezsérových médiích
  • Adsorpce sérových proteinů na biomateriály pro ortopedické aplikace
  • Proteomická charakterizace tkání odoperovaných při stomatochirurgických zákrocích
  • Studium proteomické reflexe patologických stavů tkání odoperovaných v otorhinolaryngologii
  • Identifikace proteinových pojiv v uměleckých dílech
  • Analýzy archeologických nálezů (např. určování zvířecího druhu kostí)
  • Forenzní analýza (např. druhové určení kožních derivátů)
  • Charakterizace odpovědí rostlin na biotické i abiotické stresy
 

Metodika

  • Identifikace a relativní kvantifikace proteinů pomocí LC-ESI-Q-TOF a LC-timsTOF
  • Peptidové mapování s koncovkou MALDI-TOF
  • Biotyping identifikace mikroorganismů (poskytovaná servisní služba)
Aktualizováno: 12.3.2024 14:30, Autor: Michal Strejček


VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

zobrazit plnou verzi