Divize mikrobiologie se zaměřuje na mikrobiologická témata souvísející s metabolizmem, oxidačním stresem a výskumem nových antimikrobiálních látek. V redox laboratoři se snažím objasnit složité a málo prozkoumané mechanismy, přes které světlo, oxidační stres a další enviromentální faktory ovlyvňují na buněčné a molekulární úrovni mikroorganismy, zejména bakterie a kvasinky, se kterými u nás v laboratoři pracujeme.
Fotodynamická inaktivace mikroorganismů (PDI)
V naší laboratoři zkoumáme fascinující svět fotoinaktivace, procesu založeném na stejném principu jako je fotodynamická terapie, po kterém jsou bakterie inaktivovány vlyvem reaktivních forem kyslíku (ROS). ROS jsou generovány fotosenzitizérem, který je ozářený světlem o jistých vlnových délkach. Ponořujeme se do složitosti této problematiky a podílíme se tak na vývoji nových metod desinfekce a sterilace,
s potenciálním přesahem do důležitých oborů jako je zdravotnictví, bezpečnosti potravin nebo taky úprava vody.
Zabýváme se i samotným testováním nových antibakteriálních látek a fotosenzitizérů pro PDI, jako například molybdénových klastrů, již dobře prozkoumanou methylénovou modř nebo i nanoroboty. Vyhodnocujeme toxické efekty na plaktonních formách bakterií, nebo taky na více rezistentním, běžně vyskutujíciímu se biofimu.
Oxidační stres u mikroorganizmů
Mimo jiné, i z mikrobiologického hlediska klademe významný důraz na zkoumání vlyvu oxidačního stresu u bakterií či kvasinek. K oxidačnímu stresu dochází v momentě, když jsou buňky vystaveny nerovnováze mezi produkcí reaktivních forem kyslíku (ROS) a jejich detoxokačními mechanizmy. Snažíme se odhalit, jak mikroorganizmy odpovídají na oxidační stres a jak se adaptují na své prostředí. Právě výskum těchto fenoménů je nezbytný k pochopení strategií virulence a přežití u patogenních bakterií, nebo role kvsinek v biotechnologických procesech
Na odhalení těchto jevů využíváme techniky kultivace, metodu měření antioxidační kapacity, detekci produkci ROS prostřednictvím fluorescenčních prób, optickou, ale i konfokalní fluorescenční mikroskopii a mnoho dalších technik.
