Domů Projekty Publikace
Během posledních dvou století prošla mikrobiologie a jí příbuzné biologické vědy obrovským vývojem, a současné poznání jen potvrzuje prohlášení nejvýznamnějšího mikrobiologa 19. století Louise Pasteura. Naše mikrobiologická laboratoř a problematiky, které řešíme, spadají do několika oblastí. Velká pozornost je věnována potravinářské mikrobiologii, což je dáno i historicky - Ústav biochemie a mikrobiologie patří pod Fakultu potravinářské a biochemické technologie. V posledních dvaceti letech se problematika laboratoře značně rozšířila. V roce 2004 byla potvrzena činnost akreditované Zkušební laboratoře pro potravinářskou mikrobiologii (PM) a geneticky modifikované organismy (GMO). Vedle této činnosti je vědecký výzkum v oblasti PM podpořen několika projekty grantových agentur. Stejně tak i v oblasti aplikované mikrobiologie řešíme v současné době několik aktuálních problémů.
V následující části jsou postupně uvedeny jednotlivé oblasti výzkumu a projekty získané v jednotlivých oblastech zaměření naší pracovní skupiny.
Oblasti zaměření naší pracovní skupiny:
- Potravinářská mikrobiologie
- Aplikovaná mikrobiologie
- GMO
Potravinové patogeny, se kterými pracujeme:
- Salmonella sp., Escherichia coli, Cronobacter sp., Campylobacter jejuni / coli, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes
Co nás na nich zajímá:
- identifikace klasickými a moderními metodami
- vývoj rychlých metod stanovení
- genotypizace
- rezistence k antibiotikům
- exprese faktorů virulence a dalších vybraných genů
- produkce enterotoxinů u S. aureus
- tvorba biofilmu a odolnost biofilmu vůči antimikrobiálním látkám
- termorezistence
Metody, které používáme:
- kultivační a identifikační metody klasické potravinářské mikrobiologie včetně ISO metod
- identifikace mikroorganismů metodou MALDI-TOF MS
- detekce a identifikace potravinářsky významných mikroorganismů pomocí PCR
- izolace DNA a RNA
- detekce a kvantifikace genů pomocí end-point PCR a qPCR
- Sangerovo sekvenování genových sekvencí
- genotypizační metody (PFGE, AFLP, RAPD, ERIC, MLST, mP-BiT…)
- moderní sekvenační metody (nanopórové sekvenování)
- detekce SNP metodou MALDI-TOF MS
- detekce aktivit beta-laktamáz metodou MALDI-TOF MS
- transkripce vybraných bakteriálních genů (qPCR)
- konfokální mikroskopie se zaměřením na kvantifikaci a rekonstrukci struktury biofilmů
- bioluminiscenční analýza aktivit signálních molekul systému quorum sensing
